Protein–RNA interactions for Protein: P62877

RBX1, E3 ubiquitin-protein ligase RBX1, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBX1P62877 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBX1P62877 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBX1P62877 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBX1P62877 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBX1P62877 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBX1P62877 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBX1P62877 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBX1P62877 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBX1P62877 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBX1P62877 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBX1P62877 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBX1P62877 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBX1P62877 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RBX1P62877 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RBX1P62877 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RBX1P62877 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RBX1P62877 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RBX1P62877 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RBX1P62877 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RBX1P62877 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RBX1P62877 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RBX1P62877 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RBX1P62877 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RBX1P62877 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RBX1P62877 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RBX1P62877 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RBX1P62877 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RBX1P62877 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RBX1P62877 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RBX1P62877 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RBX1P62877 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RBX1P62877 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBX1P62877 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBX1P62877 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBX1P62877 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBX1P62877 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBX1P62877 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBX1P62877 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBX1P62877 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBX1P62877 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBX1P62877 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBX1P62877 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBX1P62877 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RBX1P62877 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBX1P62877 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBX1P62877 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBX1P62877 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBX1P62877 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBX1P62877 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBX1P62877 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBX1P62877 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RBX1P62877 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBX1P62877 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBX1P62877 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBX1P62877 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBX1P62877 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBX1P62877 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBX1P62877 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBX1P62877 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBX1P62877 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBX1P62877 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBX1P62877 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBX1P62877 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBX1P62877 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBX1P62877 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBX1P62877 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBX1P62877 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBX1P62877 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBX1P62877 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBX1P62877 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBX1P62877 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBX1P62877 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBX1P62877 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBX1P62877 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBX1P62877 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBX1P62877 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBX1P62877 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBX1P62877 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBX1P62877 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBX1P62877 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBX1P62877 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBX1P62877 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBX1P62877 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RBX1P62877 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RBX1P62877 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RBX1P62877 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RBX1P62877 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RBX1P62877 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RBX1P62877 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RBX1P62877 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBX1P62877 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBX1P62877 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBX1P62877 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBX1P62877 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBX1P62877 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBX1P62877 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RBX1P62877 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBX1P62877 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBX1P62877 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RBX1P62877 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms