Protein–RNA interactions for Protein: P59025

RTP1, Receptor-transporting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP1P59025 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
RTP1P59025 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RTP1P59025 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.52■■■□□ 2
RTP1P59025 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RTP1P59025 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
RTP1P59025 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
RTP1P59025 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
RTP1P59025 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RTP1P59025 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RTP1P59025 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RTP1P59025 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RTP1P59025 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RTP1P59025 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RTP1P59025 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RTP1P59025 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RTP1P59025 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RTP1P59025 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RTP1P59025 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RTP1P59025 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
RTP1P59025 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RTP1P59025 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RTP1P59025 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RTP1P59025 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RTP1P59025 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RTP1P59025 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RTP1P59025 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RTP1P59025 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RTP1P59025 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RTP1P59025 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RTP1P59025 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RTP1P59025 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RTP1P59025 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
RTP1P59025 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RTP1P59025 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RTP1P59025 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RTP1P59025 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RTP1P59025 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RTP1P59025 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RTP1P59025 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RTP1P59025 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RTP1P59025 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RTP1P59025 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RTP1P59025 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RTP1P59025 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RTP1P59025 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RTP1P59025 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RTP1P59025 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
RTP1P59025 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RTP1P59025 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RTP1P59025 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RTP1P59025 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RTP1P59025 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RTP1P59025 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RTP1P59025 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RTP1P59025 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RTP1P59025 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RTP1P59025 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RTP1P59025 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RTP1P59025 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
RTP1P59025 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
RTP1P59025 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RTP1P59025 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RTP1P59025 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RTP1P59025 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RTP1P59025 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RTP1P59025 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RTP1P59025 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RTP1P59025 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RTP1P59025 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RTP1P59025 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RTP1P59025 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RTP1P59025 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RTP1P59025 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RTP1P59025 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RTP1P59025 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RTP1P59025 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RTP1P59025 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RTP1P59025 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RTP1P59025 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RTP1P59025 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RTP1P59025 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RTP1P59025 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RTP1P59025 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RTP1P59025 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
RTP1P59025 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RTP1P59025 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RTP1P59025 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RTP1P59025 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RTP1P59025 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RTP1P59025 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RTP1P59025 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RTP1P59025 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RTP1P59025 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RTP1P59025 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RTP1P59025 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RTP1P59025 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RTP1P59025 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RTP1P59025 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RTP1P59025 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RTP1P59025 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms