Protein–RNA interactions for Protein: P55008

AIF1, Allograft inflammatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIF1P55008 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AIF1P55008 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
AIF1P55008 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
AIF1P55008 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
AIF1P55008 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AIF1P55008 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AIF1P55008 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
AIF1P55008 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
AIF1P55008 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AIF1P55008 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AIF1P55008 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
AIF1P55008 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
AIF1P55008 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AIF1P55008 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AIF1P55008 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AIF1P55008 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AIF1P55008 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AIF1P55008 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AIF1P55008 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AIF1P55008 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AIF1P55008 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
AIF1P55008 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AIF1P55008 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AIF1P55008 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AIF1P55008 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AIF1P55008 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AIF1P55008 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AIF1P55008 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
AIF1P55008 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AIF1P55008 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AIF1P55008 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AIF1P55008 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AIF1P55008 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AIF1P55008 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
AIF1P55008 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AIF1P55008 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AIF1P55008 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AIF1P55008 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AIF1P55008 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AIF1P55008 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AIF1P55008 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AIF1P55008 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AIF1P55008 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AIF1P55008 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
AIF1P55008 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AIF1P55008 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AIF1P55008 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AIF1P55008 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AIF1P55008 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AIF1P55008 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AIF1P55008 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AIF1P55008 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AIF1P55008 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AIF1P55008 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
AIF1P55008 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
AIF1P55008 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
AIF1P55008 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AIF1P55008 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
AIF1P55008 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
AIF1P55008 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AIF1P55008 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
AIF1P55008 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
AIF1P55008 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
AIF1P55008 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AIF1P55008 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AIF1P55008 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
AIF1P55008 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
AIF1P55008 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
AIF1P55008 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AIF1P55008 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AIF1P55008 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AIF1P55008 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AIF1P55008 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AIF1P55008 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
AIF1P55008 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AIF1P55008 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AIF1P55008 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AIF1P55008 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AIF1P55008 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AIF1P55008 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AIF1P55008 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
AIF1P55008 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AIF1P55008 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
AIF1P55008 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
AIF1P55008 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AIF1P55008 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AIF1P55008 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AIF1P55008 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AIF1P55008 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AIF1P55008 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AIF1P55008 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AIF1P55008 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AIF1P55008 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AIF1P55008 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AIF1P55008 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
AIF1P55008 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AIF1P55008 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AIF1P55008 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AIF1P55008 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AIF1P55008 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms