Protein–RNA interactions for Protein: P49918

CDKN1C, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1CP49918 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDKN1CP49918 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDKN1CP49918 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDKN1CP49918 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CDKN1CP49918 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CDKN1CP49918 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDKN1CP49918 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDKN1CP49918 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDKN1CP49918 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CDKN1CP49918 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDKN1CP49918 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDKN1CP49918 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDKN1CP49918 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDKN1CP49918 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDKN1CP49918 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDKN1CP49918 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CDKN1CP49918 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDKN1CP49918 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDKN1CP49918 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDKN1CP49918 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDKN1CP49918 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CDKN1CP49918 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDKN1CP49918 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDKN1CP49918 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDKN1CP49918 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDKN1CP49918 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDKN1CP49918 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDKN1CP49918 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDKN1CP49918 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDKN1CP49918 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDKN1CP49918 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDKN1CP49918 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDKN1CP49918 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDKN1CP49918 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDKN1CP49918 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CDKN1CP49918 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDKN1CP49918 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDKN1CP49918 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDKN1CP49918 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDKN1CP49918 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDKN1CP49918 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDKN1CP49918 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDKN1CP49918 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDKN1CP49918 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDKN1CP49918 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDKN1CP49918 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDKN1CP49918 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDKN1CP49918 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDKN1CP49918 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CDKN1CP49918 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDKN1CP49918 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDKN1CP49918 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDKN1CP49918 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDKN1CP49918 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDKN1CP49918 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDKN1CP49918 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CDKN1CP49918 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CDKN1CP49918 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDKN1CP49918 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDKN1CP49918 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDKN1CP49918 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDKN1CP49918 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDKN1CP49918 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDKN1CP49918 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDKN1CP49918 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDKN1CP49918 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDKN1CP49918 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
CDKN1CP49918 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDKN1CP49918 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDKN1CP49918 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDKN1CP49918 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDKN1CP49918 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDKN1CP49918 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDKN1CP49918 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDKN1CP49918 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CDKN1CP49918 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDKN1CP49918 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDKN1CP49918 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CDKN1CP49918 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDKN1CP49918 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDKN1CP49918 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDKN1CP49918 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDKN1CP49918 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDKN1CP49918 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDKN1CP49918 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDKN1CP49918 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDKN1CP49918 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDKN1CP49918 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDKN1CP49918 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDKN1CP49918 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDKN1CP49918 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDKN1CP49918 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDKN1CP49918 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDKN1CP49918 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDKN1CP49918 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDKN1CP49918 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDKN1CP49918 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDKN1CP49918 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDKN1CP49918 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDKN1CP49918 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms