Protein–RNA interactions for Protein: P47895

ALDH1A3, Aldehyde dehydrogenase family 1 member A3, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A3P47895 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALDH1A3P47895 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALDH1A3P47895 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALDH1A3P47895 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALDH1A3P47895 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALDH1A3P47895 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALDH1A3P47895 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALDH1A3P47895 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALDH1A3P47895 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALDH1A3P47895 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALDH1A3P47895 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALDH1A3P47895 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALDH1A3P47895 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALDH1A3P47895 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALDH1A3P47895 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALDH1A3P47895 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALDH1A3P47895 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALDH1A3P47895 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ALDH1A3P47895 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALDH1A3P47895 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALDH1A3P47895 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALDH1A3P47895 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ALDH1A3P47895 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ALDH1A3P47895 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ALDH1A3P47895 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ALDH1A3P47895 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ALDH1A3P47895 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ALDH1A3P47895 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ALDH1A3P47895 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ALDH1A3P47895 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ALDH1A3P47895 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ALDH1A3P47895 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ALDH1A3P47895 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ALDH1A3P47895 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ALDH1A3P47895 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ALDH1A3P47895 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ALDH1A3P47895 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ALDH1A3P47895 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALDH1A3P47895 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALDH1A3P47895 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALDH1A3P47895 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALDH1A3P47895 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALDH1A3P47895 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALDH1A3P47895 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALDH1A3P47895 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ALDH1A3P47895 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALDH1A3P47895 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALDH1A3P47895 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ALDH1A3P47895 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ALDH1A3P47895 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ALDH1A3P47895 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ALDH1A3P47895 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ALDH1A3P47895 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ALDH1A3P47895 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ALDH1A3P47895 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ALDH1A3P47895 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ALDH1A3P47895 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALDH1A3P47895 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ALDH1A3P47895 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALDH1A3P47895 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALDH1A3P47895 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALDH1A3P47895 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ALDH1A3P47895 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALDH1A3P47895 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALDH1A3P47895 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALDH1A3P47895 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ALDH1A3P47895 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ALDH1A3P47895 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ALDH1A3P47895 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ALDH1A3P47895 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ALDH1A3P47895 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ALDH1A3P47895 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ALDH1A3P47895 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ALDH1A3P47895 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ALDH1A3P47895 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ALDH1A3P47895 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALDH1A3P47895 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALDH1A3P47895 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALDH1A3P47895 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALDH1A3P47895 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALDH1A3P47895 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALDH1A3P47895 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALDH1A3P47895 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALDH1A3P47895 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALDH1A3P47895 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALDH1A3P47895 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ALDH1A3P47895 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ALDH1A3P47895 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ALDH1A3P47895 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ALDH1A3P47895 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ALDH1A3P47895 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ALDH1A3P47895 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ALDH1A3P47895 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ALDH1A3P47895 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ALDH1A3P47895 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ALDH1A3P47895 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ALDH1A3P47895 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ALDH1A3P47895 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ALDH1A3P47895 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ALDH1A3P47895 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms