Protein–RNA interactions for Protein: P40855

PEX19, Peroxisomal biogenesis factor 19, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX19P40855 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PEX19P40855 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PEX19P40855 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PEX19P40855 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PEX19P40855 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PEX19P40855 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PEX19P40855 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PEX19P40855 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PEX19P40855 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PEX19P40855 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PEX19P40855 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PEX19P40855 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PEX19P40855 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PEX19P40855 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PEX19P40855 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PEX19P40855 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PEX19P40855 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PEX19P40855 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PEX19P40855 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PEX19P40855 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PEX19P40855 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PEX19P40855 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PEX19P40855 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PEX19P40855 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PEX19P40855 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PEX19P40855 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PEX19P40855 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PEX19P40855 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PEX19P40855 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PEX19P40855 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PEX19P40855 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PEX19P40855 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PEX19P40855 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PEX19P40855 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PEX19P40855 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PEX19P40855 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PEX19P40855 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PEX19P40855 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PEX19P40855 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PEX19P40855 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PEX19P40855 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PEX19P40855 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PEX19P40855 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PEX19P40855 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PEX19P40855 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PEX19P40855 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PEX19P40855 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PEX19P40855 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PEX19P40855 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PEX19P40855 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PEX19P40855 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PEX19P40855 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PEX19P40855 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PEX19P40855 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PEX19P40855 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PEX19P40855 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PEX19P40855 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PEX19P40855 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PEX19P40855 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PEX19P40855 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PEX19P40855 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PEX19P40855 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PEX19P40855 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PEX19P40855 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PEX19P40855 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PEX19P40855 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PEX19P40855 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PEX19P40855 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PEX19P40855 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PEX19P40855 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PEX19P40855 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PEX19P40855 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PEX19P40855 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PEX19P40855 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PEX19P40855 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PEX19P40855 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PEX19P40855 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PEX19P40855 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PEX19P40855 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PEX19P40855 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PEX19P40855 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PEX19P40855 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PEX19P40855 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PEX19P40855 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PEX19P40855 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PEX19P40855 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PEX19P40855 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PEX19P40855 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PEX19P40855 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PEX19P40855 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PEX19P40855 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PEX19P40855 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PEX19P40855 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PEX19P40855 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PEX19P40855 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PEX19P40855 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PEX19P40855 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PEX19P40855 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PEX19P40855 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PEX19P40855 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms