Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPA3P35244 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPA3P35244 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPA3P35244 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPA3P35244 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPA3P35244 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPA3P35244 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPA3P35244 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RPA3P35244 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPA3P35244 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPA3P35244 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPA3P35244 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPA3P35244 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RPA3P35244 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPA3P35244 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPA3P35244 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPA3P35244 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPA3P35244 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPA3P35244 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPA3P35244 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPA3P35244 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RPA3P35244 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPA3P35244 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RPA3P35244 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPA3P35244 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPA3P35244 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPA3P35244 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPA3P35244 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPA3P35244 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPA3P35244 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPA3P35244 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPA3P35244 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPA3P35244 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPA3P35244 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPA3P35244 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPA3P35244 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPA3P35244 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPA3P35244 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPA3P35244 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPA3P35244 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPA3P35244 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPA3P35244 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPA3P35244 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPA3P35244 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPA3P35244 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPA3P35244 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPA3P35244 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPA3P35244 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RPA3P35244 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPA3P35244 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPA3P35244 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPA3P35244 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPA3P35244 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPA3P35244 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPA3P35244 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPA3P35244 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPA3P35244 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPA3P35244 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPA3P35244 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPA3P35244 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPA3P35244 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPA3P35244 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPA3P35244 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPA3P35244 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPA3P35244 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPA3P35244 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RPA3P35244 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPA3P35244 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPA3P35244 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPA3P35244 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPA3P35244 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPA3P35244 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPA3P35244 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPA3P35244 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPA3P35244 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPA3P35244 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPA3P35244 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPA3P35244 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPA3P35244 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPA3P35244 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RPA3P35244 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPA3P35244 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPA3P35244 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPA3P35244 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPA3P35244 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPA3P35244 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPA3P35244 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPA3P35244 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPA3P35244 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPA3P35244 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPA3P35244 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPA3P35244 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RPA3P35244 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPA3P35244 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPA3P35244 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPA3P35244 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPA3P35244 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPA3P35244 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPA3P35244 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RPA3P35244 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms