Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
USP6P35125 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
USP6P35125 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
USP6P35125 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
USP6P35125 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
USP6P35125 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
USP6P35125 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC33.31■■■□□ 2.92
USP6P35125 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
USP6P35125 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
USP6P35125 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
USP6P35125 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
USP6P35125 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
USP6P35125 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
USP6P35125 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
USP6P35125 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
USP6P35125 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
USP6P35125 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
USP6P35125 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
USP6P35125 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
USP6P35125 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
USP6P35125 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
USP6P35125 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
USP6P35125 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
USP6P35125 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
USP6P35125 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
USP6P35125 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
USP6P35125 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
USP6P35125 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC33.27■■■□□ 2.92
USP6P35125 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
USP6P35125 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
USP6P35125 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
USP6P35125 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
USP6P35125 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
USP6P35125 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
USP6P35125 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
USP6P35125 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
USP6P35125 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
USP6P35125 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
USP6P35125 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
USP6P35125 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
USP6P35125 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
USP6P35125 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
USP6P35125 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
USP6P35125 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
USP6P35125 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
USP6P35125 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
USP6P35125 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
USP6P35125 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
USP6P35125 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
USP6P35125 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
USP6P35125 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
USP6P35125 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
USP6P35125 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
USP6P35125 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
USP6P35125 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
USP6P35125 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
USP6P35125 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
USP6P35125 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
USP6P35125 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
USP6P35125 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
USP6P35125 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
USP6P35125 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
USP6P35125 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
USP6P35125 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
USP6P35125 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
USP6P35125 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
USP6P35125 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
USP6P35125 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
USP6P35125 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
USP6P35125 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
USP6P35125 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
USP6P35125 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
USP6P35125 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
USP6P35125 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
USP6P35125 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
USP6P35125 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
USP6P35125 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
USP6P35125 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
USP6P35125 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
USP6P35125 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
USP6P35125 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
USP6P35125 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
USP6P35125 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
USP6P35125 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
USP6P35125 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
USP6P35125 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
USP6P35125 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
USP6P35125 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
USP6P35125 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
USP6P35125 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
USP6P35125 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
USP6P35125 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
USP6P35125 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
USP6P35125 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
USP6P35125 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
USP6P35125 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
USP6P35125 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
USP6P35125 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
USP6P35125 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
USP6P35125 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.6 ms