Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HOXA7P31268 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HOXA7P31268 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HOXA7P31268 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HOXA7P31268 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HOXA7P31268 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HOXA7P31268 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HOXA7P31268 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HOXA7P31268 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HOXA7P31268 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HOXA7P31268 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HOXA7P31268 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HOXA7P31268 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
HOXA7P31268 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HOXA7P31268 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HOXA7P31268 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HOXA7P31268 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
HOXA7P31268 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HOXA7P31268 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HOXA7P31268 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HOXA7P31268 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HOXA7P31268 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HOXA7P31268 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HOXA7P31268 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HOXA7P31268 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HOXA7P31268 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HOXA7P31268 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HOXA7P31268 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
HOXA7P31268 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HOXA7P31268 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
HOXA7P31268 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HOXA7P31268 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HOXA7P31268 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HOXA7P31268 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
HOXA7P31268 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HOXA7P31268 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HOXA7P31268 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HOXA7P31268 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HOXA7P31268 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HOXA7P31268 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HOXA7P31268 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HOXA7P31268 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HOXA7P31268 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HOXA7P31268 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HOXA7P31268 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
HOXA7P31268 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HOXA7P31268 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HOXA7P31268 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HOXA7P31268 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HOXA7P31268 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HOXA7P31268 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HOXA7P31268 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HOXA7P31268 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HOXA7P31268 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HOXA7P31268 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HOXA7P31268 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HOXA7P31268 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HOXA7P31268 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HOXA7P31268 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HOXA7P31268 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HOXA7P31268 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HOXA7P31268 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HOXA7P31268 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HOXA7P31268 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HOXA7P31268 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HOXA7P31268 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HOXA7P31268 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HOXA7P31268 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HOXA7P31268 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HOXA7P31268 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HOXA7P31268 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HOXA7P31268 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HOXA7P31268 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HOXA7P31268 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HOXA7P31268 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HOXA7P31268 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HOXA7P31268 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HOXA7P31268 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
HOXA7P31268 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
HOXA7P31268 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HOXA7P31268 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
HOXA7P31268 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
HOXA7P31268 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HOXA7P31268 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HOXA7P31268 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HOXA7P31268 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HOXA7P31268 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
HOXA7P31268 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HOXA7P31268 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
HOXA7P31268 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HOXA7P31268 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
HOXA7P31268 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HOXA7P31268 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HOXA7P31268 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HOXA7P31268 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HOXA7P31268 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HOXA7P31268 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HOXA7P31268 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HOXA7P31268 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HOXA7P31268 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms