Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
HOXA10P31260 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
HOXA10P31260 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
HOXA10P31260 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
HOXA10P31260 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
HOXA10P31260 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC30.18■■■□□ 2.42
HOXA10P31260 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
HOXA10P31260 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
HOXA10P31260 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
HOXA10P31260 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
HOXA10P31260 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
HOXA10P31260 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
HOXA10P31260 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
HOXA10P31260 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
HOXA10P31260 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
HOXA10P31260 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
HOXA10P31260 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
HOXA10P31260 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
HOXA10P31260 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
HOXA10P31260 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
HOXA10P31260 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
HOXA10P31260 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
HOXA10P31260 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
HOXA10P31260 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
HOXA10P31260 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
HOXA10P31260 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
HOXA10P31260 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
HOXA10P31260 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
HOXA10P31260 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
HOXA10P31260 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
HOXA10P31260 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
HOXA10P31260 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
HOXA10P31260 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
HOXA10P31260 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
HOXA10P31260 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
HOXA10P31260 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
HOXA10P31260 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
HOXA10P31260 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
HOXA10P31260 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
HOXA10P31260 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
HOXA10P31260 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
HOXA10P31260 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
HOXA10P31260 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
HOXA10P31260 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
HOXA10P31260 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
HOXA10P31260 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
HOXA10P31260 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
HOXA10P31260 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
HOXA10P31260 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
HOXA10P31260 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
HOXA10P31260 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
HOXA10P31260 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
HOXA10P31260 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
HOXA10P31260 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
HOXA10P31260 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
HOXA10P31260 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
HOXA10P31260 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
HOXA10P31260 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
HOXA10P31260 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
HOXA10P31260 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
HOXA10P31260 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
HOXA10P31260 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
HOXA10P31260 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
HOXA10P31260 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
HOXA10P31260 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
HOXA10P31260 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
HOXA10P31260 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
HOXA10P31260 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
HOXA10P31260 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
HOXA10P31260 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
HOXA10P31260 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
HOXA10P31260 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
HOXA10P31260 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
HOXA10P31260 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC30.05■■■□□ 2.4
HOXA10P31260 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
HOXA10P31260 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
HOXA10P31260 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
HOXA10P31260 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
HOXA10P31260 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
HOXA10P31260 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
HOXA10P31260 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
HOXA10P31260 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
HOXA10P31260 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
HOXA10P31260 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
HOXA10P31260 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
HOXA10P31260 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
HOXA10P31260 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
HOXA10P31260 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
HOXA10P31260 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
HOXA10P31260 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
HOXA10P31260 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
HOXA10P31260 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
HOXA10P31260 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
HOXA10P31260 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
HOXA10P31260 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
HOXA10P31260 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
HOXA10P31260 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
HOXA10P31260 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
HOXA10P31260 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC30■■■□□ 2.39
HOXA10P31260 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms