Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
COL4A5P29400 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
COL4A5P29400 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.76■■■□□ 2.36
COL4A5P29400 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
COL4A5P29400 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
COL4A5P29400 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
COL4A5P29400 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
COL4A5P29400 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
COL4A5P29400 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
COL4A5P29400 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
COL4A5P29400 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
COL4A5P29400 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
COL4A5P29400 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
COL4A5P29400 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
COL4A5P29400 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
COL4A5P29400 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
COL4A5P29400 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
COL4A5P29400 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
COL4A5P29400 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
COL4A5P29400 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
COL4A5P29400 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
COL4A5P29400 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
COL4A5P29400 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
COL4A5P29400 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
COL4A5P29400 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
COL4A5P29400 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
COL4A5P29400 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
COL4A5P29400 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
COL4A5P29400 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
COL4A5P29400 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
COL4A5P29400 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
COL4A5P29400 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
COL4A5P29400 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
COL4A5P29400 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
COL4A5P29400 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
COL4A5P29400 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
COL4A5P29400 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
COL4A5P29400 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
COL4A5P29400 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
COL4A5P29400 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
COL4A5P29400 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
COL4A5P29400 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
COL4A5P29400 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
COL4A5P29400 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
COL4A5P29400 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
COL4A5P29400 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
COL4A5P29400 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
COL4A5P29400 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
COL4A5P29400 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
COL4A5P29400 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
COL4A5P29400 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
COL4A5P29400 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
COL4A5P29400 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
COL4A5P29400 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
COL4A5P29400 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
COL4A5P29400 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
COL4A5P29400 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
COL4A5P29400 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
COL4A5P29400 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
COL4A5P29400 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
COL4A5P29400 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
COL4A5P29400 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
COL4A5P29400 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
COL4A5P29400 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
COL4A5P29400 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
COL4A5P29400 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
COL4A5P29400 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
COL4A5P29400 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
COL4A5P29400 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
COL4A5P29400 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
COL4A5P29400 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
COL4A5P29400 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
COL4A5P29400 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
COL4A5P29400 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
COL4A5P29400 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
COL4A5P29400 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
COL4A5P29400 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
COL4A5P29400 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
COL4A5P29400 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
COL4A5P29400 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
COL4A5P29400 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
COL4A5P29400 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
COL4A5P29400 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
COL4A5P29400 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
COL4A5P29400 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
COL4A5P29400 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
COL4A5P29400 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
COL4A5P29400 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
COL4A5P29400 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
COL4A5P29400 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
COL4A5P29400 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
COL4A5P29400 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
COL4A5P29400 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
COL4A5P29400 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
COL4A5P29400 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
COL4A5P29400 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
COL4A5P29400 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
COL4A5P29400 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
COL4A5P29400 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
COL4A5P29400 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms