Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LOXP28300 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LOXP28300 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LOXP28300 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LOXP28300 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LOXP28300 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LOXP28300 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
LOXP28300 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LOXP28300 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LOXP28300 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LOXP28300 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LOXP28300 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
LOXP28300 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LOXP28300 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LOXP28300 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LOXP28300 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LOXP28300 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LOXP28300 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LOXP28300 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
LOXP28300 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
LOXP28300 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LOXP28300 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LOXP28300 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LOXP28300 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LOXP28300 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LOXP28300 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LOXP28300 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LOXP28300 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LOXP28300 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LOXP28300 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LOXP28300 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LOXP28300 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LOXP28300 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LOXP28300 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LOXP28300 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LOXP28300 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LOXP28300 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
LOXP28300 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
LOXP28300 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
LOXP28300 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LOXP28300 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LOXP28300 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LOXP28300 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LOXP28300 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LOXP28300 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LOXP28300 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LOXP28300 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LOXP28300 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LOXP28300 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LOXP28300 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LOXP28300 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LOXP28300 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LOXP28300 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LOXP28300 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LOXP28300 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LOXP28300 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LOXP28300 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LOXP28300 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LOXP28300 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LOXP28300 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LOXP28300 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LOXP28300 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LOXP28300 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LOXP28300 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LOXP28300 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LOXP28300 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LOXP28300 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LOXP28300 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LOXP28300 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LOXP28300 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LOXP28300 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
LOXP28300 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LOXP28300 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LOXP28300 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LOXP28300 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LOXP28300 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LOXP28300 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LOXP28300 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LOXP28300 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LOXP28300 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LOXP28300 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LOXP28300 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LOXP28300 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LOXP28300 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LOXP28300 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LOXP28300 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LOXP28300 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
LOXP28300 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
LOXP28300 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LOXP28300 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LOXP28300 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LOXP28300 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
LOXP28300 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LOXP28300 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LOXP28300 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LOXP28300 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LOXP28300 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LOXP28300 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LOXP28300 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LOXP28300 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 346.7 ms