Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLNP26678 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLNP26678 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLNP26678 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLNP26678 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLNP26678 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLNP26678 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLNP26678 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PLNP26678 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PLNP26678 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PLNP26678 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PLNP26678 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PLNP26678 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PLNP26678 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PLNP26678 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PLNP26678 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PLNP26678 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PLNP26678 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PLNP26678 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLNP26678 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLNP26678 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLNP26678 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLNP26678 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLNP26678 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLNP26678 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLNP26678 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLNP26678 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PLNP26678 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PLNP26678 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PLNP26678 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PLNP26678 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PLNP26678 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PLNP26678 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PLNP26678 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PLNP26678 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PLNP26678 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLNP26678 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLNP26678 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLNP26678 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLNP26678 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLNP26678 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLNP26678 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLNP26678 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
PLNP26678 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PLNP26678 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PLNP26678 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PLNP26678 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PLNP26678 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PLNP26678 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PLNP26678 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PLNP26678 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PLNP26678 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PLNP26678 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PLNP26678 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PLNP26678 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PLNP26678 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PLNP26678 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PLNP26678 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLNP26678 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLNP26678 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLNP26678 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLNP26678 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PLNP26678 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLNP26678 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLNP26678 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLNP26678 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLNP26678 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLNP26678 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLNP26678 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLNP26678 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLNP26678 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLNP26678 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLNP26678 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLNP26678 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLNP26678 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PLNP26678 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLNP26678 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLNP26678 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLNP26678 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLNP26678 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLNP26678 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLNP26678 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLNP26678 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLNP26678 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLNP26678 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLNP26678 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLNP26678 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLNP26678 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLNP26678 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLNP26678 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLNP26678 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLNP26678 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLNP26678 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLNP26678 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLNP26678 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLNP26678 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLNP26678 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLNP26678 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLNP26678 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLNP26678 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.2 ms