Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMA3P25788 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMA3P25788 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMA3P25788 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMA3P25788 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMA3P25788 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PSMA3P25788 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMA3P25788 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMA3P25788 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMA3P25788 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMA3P25788 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMA3P25788 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMA3P25788 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMA3P25788 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMA3P25788 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMA3P25788 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMA3P25788 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMA3P25788 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMA3P25788 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMA3P25788 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMA3P25788 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMA3P25788 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMA3P25788 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMA3P25788 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMA3P25788 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMA3P25788 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMA3P25788 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMA3P25788 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMA3P25788 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMA3P25788 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMA3P25788 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMA3P25788 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMA3P25788 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMA3P25788 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMA3P25788 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMA3P25788 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMA3P25788 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMA3P25788 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMA3P25788 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMA3P25788 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMA3P25788 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMA3P25788 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMA3P25788 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PSMA3P25788 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PSMA3P25788 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSMA3P25788 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMA3P25788 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMA3P25788 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMA3P25788 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMA3P25788 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMA3P25788 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMA3P25788 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMA3P25788 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMA3P25788 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMA3P25788 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMA3P25788 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMA3P25788 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMA3P25788 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMA3P25788 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMA3P25788 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMA3P25788 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMA3P25788 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMA3P25788 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMA3P25788 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMA3P25788 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMA3P25788 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMA3P25788 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMA3P25788 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMA3P25788 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMA3P25788 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMA3P25788 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMA3P25788 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMA3P25788 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMA3P25788 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMA3P25788 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMA3P25788 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMA3P25788 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMA3P25788 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMA3P25788 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMA3P25788 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMA3P25788 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMA3P25788 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMA3P25788 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMA3P25788 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMA3P25788 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMA3P25788 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMA3P25788 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMA3P25788 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMA3P25788 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMA3P25788 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMA3P25788 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMA3P25788 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMA3P25788 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMA3P25788 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMA3P25788 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMA3P25788 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMA3P25788 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMA3P25788 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMA3P25788 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMA3P25788 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.6 ms