Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VAMP1P23763 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VAMP1P23763 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VAMP1P23763 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VAMP1P23763 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VAMP1P23763 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VAMP1P23763 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
VAMP1P23763 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VAMP1P23763 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VAMP1P23763 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VAMP1P23763 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VAMP1P23763 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAMP1P23763 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAMP1P23763 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAMP1P23763 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAMP1P23763 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAMP1P23763 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAMP1P23763 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VAMP1P23763 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VAMP1P23763 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VAMP1P23763 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VAMP1P23763 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VAMP1P23763 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VAMP1P23763 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAMP1P23763 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAMP1P23763 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAMP1P23763 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAMP1P23763 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
VAMP1P23763 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAMP1P23763 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAMP1P23763 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAMP1P23763 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAMP1P23763 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAMP1P23763 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAMP1P23763 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAMP1P23763 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAMP1P23763 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAMP1P23763 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAMP1P23763 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAMP1P23763 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAMP1P23763 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAMP1P23763 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAMP1P23763 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAMP1P23763 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAMP1P23763 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
VAMP1P23763 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAMP1P23763 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAMP1P23763 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAMP1P23763 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAMP1P23763 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAMP1P23763 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAMP1P23763 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAMP1P23763 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAMP1P23763 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAMP1P23763 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAMP1P23763 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAMP1P23763 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAMP1P23763 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAMP1P23763 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAMP1P23763 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAMP1P23763 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAMP1P23763 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAMP1P23763 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAMP1P23763 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAMP1P23763 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAMP1P23763 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAMP1P23763 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAMP1P23763 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAMP1P23763 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAMP1P23763 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAMP1P23763 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAMP1P23763 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAMP1P23763 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAMP1P23763 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAMP1P23763 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAMP1P23763 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAMP1P23763 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAMP1P23763 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAMP1P23763 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAMP1P23763 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
VAMP1P23763 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
VAMP1P23763 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VAMP1P23763 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VAMP1P23763 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VAMP1P23763 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VAMP1P23763 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VAMP1P23763 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VAMP1P23763 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VAMP1P23763 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAMP1P23763 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAMP1P23763 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
VAMP1P23763 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAMP1P23763 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAMP1P23763 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAMP1P23763 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAMP1P23763 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAMP1P23763 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAMP1P23763 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAMP1P23763 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAMP1P23763 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms