Protein–RNA interactions for Protein: P20851

C4BPB, C4b-binding protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BPBP20851 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
C4BPBP20851 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C4BPBP20851 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C4BPBP20851 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C4BPBP20851 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C4BPBP20851 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C4BPBP20851 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C4BPBP20851 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C4BPBP20851 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C4BPBP20851 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C4BPBP20851 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C4BPBP20851 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C4BPBP20851 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C4BPBP20851 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C4BPBP20851 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C4BPBP20851 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C4BPBP20851 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C4BPBP20851 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C4BPBP20851 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C4BPBP20851 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C4BPBP20851 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C4BPBP20851 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C4BPBP20851 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C4BPBP20851 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C4BPBP20851 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C4BPBP20851 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C4BPBP20851 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C4BPBP20851 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
C4BPBP20851 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C4BPBP20851 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C4BPBP20851 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C4BPBP20851 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C4BPBP20851 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C4BPBP20851 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C4BPBP20851 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C4BPBP20851 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C4BPBP20851 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C4BPBP20851 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C4BPBP20851 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C4BPBP20851 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C4BPBP20851 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C4BPBP20851 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C4BPBP20851 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
C4BPBP20851 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
C4BPBP20851 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
C4BPBP20851 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
C4BPBP20851 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
C4BPBP20851 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
C4BPBP20851 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C4BPBP20851 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C4BPBP20851 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C4BPBP20851 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C4BPBP20851 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C4BPBP20851 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
C4BPBP20851 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C4BPBP20851 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C4BPBP20851 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C4BPBP20851 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C4BPBP20851 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C4BPBP20851 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
C4BPBP20851 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C4BPBP20851 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C4BPBP20851 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4BPBP20851 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4BPBP20851 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4BPBP20851 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4BPBP20851 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
C4BPBP20851 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4BPBP20851 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4BPBP20851 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4BPBP20851 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4BPBP20851 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4BPBP20851 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C4BPBP20851 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C4BPBP20851 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C4BPBP20851 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C4BPBP20851 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
C4BPBP20851 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C4BPBP20851 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C4BPBP20851 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C4BPBP20851 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C4BPBP20851 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C4BPBP20851 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C4BPBP20851 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C4BPBP20851 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C4BPBP20851 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C4BPBP20851 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C4BPBP20851 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C4BPBP20851 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
C4BPBP20851 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
C4BPBP20851 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C4BPBP20851 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C4BPBP20851 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C4BPBP20851 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
C4BPBP20851 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C4BPBP20851 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C4BPBP20851 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C4BPBP20851 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C4BPBP20851 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C4BPBP20851 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms