Protein–RNA interactions for Protein: P17050

NAGA, Alpha-N-acetylgalactosaminidase, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAGAP17050 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NAGAP17050 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NAGAP17050 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NAGAP17050 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NAGAP17050 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NAGAP17050 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NAGAP17050 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NAGAP17050 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NAGAP17050 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NAGAP17050 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NAGAP17050 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NAGAP17050 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NAGAP17050 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NAGAP17050 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NAGAP17050 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NAGAP17050 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NAGAP17050 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NAGAP17050 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NAGAP17050 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NAGAP17050 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NAGAP17050 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NAGAP17050 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NAGAP17050 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NAGAP17050 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NAGAP17050 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NAGAP17050 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NAGAP17050 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NAGAP17050 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NAGAP17050 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NAGAP17050 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NAGAP17050 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NAGAP17050 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NAGAP17050 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NAGAP17050 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NAGAP17050 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NAGAP17050 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NAGAP17050 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NAGAP17050 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NAGAP17050 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NAGAP17050 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NAGAP17050 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NAGAP17050 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NAGAP17050 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NAGAP17050 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NAGAP17050 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NAGAP17050 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NAGAP17050 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NAGAP17050 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NAGAP17050 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NAGAP17050 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NAGAP17050 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NAGAP17050 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NAGAP17050 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NAGAP17050 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NAGAP17050 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NAGAP17050 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAGAP17050 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAGAP17050 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAGAP17050 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAGAP17050 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAGAP17050 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAGAP17050 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAGAP17050 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAGAP17050 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAGAP17050 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAGAP17050 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAGAP17050 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NAGAP17050 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAGAP17050 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAGAP17050 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAGAP17050 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAGAP17050 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAGAP17050 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAGAP17050 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAGAP17050 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAGAP17050 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NAGAP17050 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAGAP17050 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAGAP17050 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAGAP17050 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NAGAP17050 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NAGAP17050 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NAGAP17050 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NAGAP17050 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NAGAP17050 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NAGAP17050 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NAGAP17050 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NAGAP17050 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NAGAP17050 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NAGAP17050 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NAGAP17050 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NAGAP17050 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NAGAP17050 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NAGAP17050 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NAGAP17050 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NAGAP17050 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NAGAP17050 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NAGAP17050 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NAGAP17050 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NAGAP17050 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms