Protein–RNA interactions for Protein: P15514

AREG, Amphiregulin, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AREGP15514 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AREGP15514 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AREGP15514 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AREGP15514 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
AREGP15514 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
AREGP15514 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AREGP15514 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
AREGP15514 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AREGP15514 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
AREGP15514 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AREGP15514 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
AREGP15514 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AREGP15514 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
AREGP15514 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
AREGP15514 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
AREGP15514 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AREGP15514 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AREGP15514 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AREGP15514 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
AREGP15514 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AREGP15514 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AREGP15514 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AREGP15514 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AREGP15514 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AREGP15514 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
AREGP15514 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AREGP15514 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
AREGP15514 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
AREGP15514 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
AREGP15514 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AREGP15514 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
AREGP15514 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AREGP15514 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AREGP15514 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AREGP15514 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AREGP15514 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AREGP15514 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AREGP15514 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AREGP15514 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AREGP15514 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AREGP15514 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AREGP15514 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
AREGP15514 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
AREGP15514 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AREGP15514 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
AREGP15514 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
AREGP15514 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
AREGP15514 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
AREGP15514 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
AREGP15514 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
AREGP15514 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
AREGP15514 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
AREGP15514 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
AREGP15514 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
AREGP15514 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
AREGP15514 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
AREGP15514 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
AREGP15514 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
AREGP15514 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
AREGP15514 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
AREGP15514 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
AREGP15514 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
AREGP15514 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
AREGP15514 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
AREGP15514 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
AREGP15514 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
AREGP15514 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
AREGP15514 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
AREGP15514 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
AREGP15514 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
AREGP15514 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
AREGP15514 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
AREGP15514 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
AREGP15514 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
AREGP15514 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
AREGP15514 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
AREGP15514 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
AREGP15514 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
AREGP15514 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
AREGP15514 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
AREGP15514 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
AREGP15514 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
AREGP15514 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
AREGP15514 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
AREGP15514 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
AREGP15514 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
AREGP15514 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
AREGP15514 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
AREGP15514 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
AREGP15514 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
AREGP15514 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
AREGP15514 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
AREGP15514 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
AREGP15514 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
AREGP15514 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
AREGP15514 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
AREGP15514 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
AREGP15514 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
AREGP15514 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
AREGP15514 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms