Protein–RNA interactions for Protein: P13631

RARG, Retinoic acid receptor gamma, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARGP13631 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RARGP13631 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RARGP13631 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RARGP13631 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RARGP13631 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RARGP13631 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RARGP13631 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RARGP13631 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RARGP13631 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RARGP13631 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RARGP13631 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RARGP13631 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RARGP13631 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RARGP13631 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RARGP13631 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RARGP13631 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RARGP13631 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RARGP13631 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RARGP13631 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RARGP13631 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RARGP13631 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RARGP13631 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RARGP13631 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RARGP13631 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RARGP13631 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RARGP13631 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RARGP13631 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RARGP13631 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RARGP13631 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RARGP13631 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RARGP13631 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RARGP13631 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RARGP13631 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RARGP13631 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RARGP13631 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RARGP13631 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RARGP13631 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RARGP13631 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RARGP13631 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RARGP13631 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RARGP13631 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RARGP13631 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RARGP13631 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RARGP13631 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RARGP13631 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RARGP13631 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RARGP13631 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RARGP13631 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RARGP13631 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RARGP13631 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RARGP13631 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RARGP13631 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RARGP13631 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RARGP13631 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RARGP13631 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RARGP13631 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RARGP13631 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RARGP13631 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RARGP13631 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RARGP13631 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RARGP13631 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RARGP13631 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RARGP13631 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
RARGP13631 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RARGP13631 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RARGP13631 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RARGP13631 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RARGP13631 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RARGP13631 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RARGP13631 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RARGP13631 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RARGP13631 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RARGP13631 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RARGP13631 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RARGP13631 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RARGP13631 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RARGP13631 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RARGP13631 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RARGP13631 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RARGP13631 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RARGP13631 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RARGP13631 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RARGP13631 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RARGP13631 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RARGP13631 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RARGP13631 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RARGP13631 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RARGP13631 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RARGP13631 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RARGP13631 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RARGP13631 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RARGP13631 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RARGP13631 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RARGP13631 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RARGP13631 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RARGP13631 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RARGP13631 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RARGP13631 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RARGP13631 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RARGP13631 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms