Protein–RNA interactions for Protein: P11274

BCR, Breakpoint cluster region protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCRP11274 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
BCRP11274 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
BCRP11274 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
BCRP11274 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
BCRP11274 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
BCRP11274 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
BCRP11274 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
BCRP11274 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
BCRP11274 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
BCRP11274 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BCRP11274 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BCRP11274 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
BCRP11274 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BCRP11274 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
BCRP11274 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
BCRP11274 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BCRP11274 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
BCRP11274 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
BCRP11274 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
BCRP11274 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BCRP11274 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BCRP11274 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BCRP11274 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
BCRP11274 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
BCRP11274 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BCRP11274 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
BCRP11274 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
BCRP11274 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
BCRP11274 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
BCRP11274 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
BCRP11274 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BCRP11274 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BCRP11274 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BCRP11274 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BCRP11274 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BCRP11274 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BCRP11274 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BCRP11274 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BCRP11274 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BCRP11274 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BCRP11274 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BCRP11274 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BCRP11274 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
BCRP11274 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BCRP11274 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
BCRP11274 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BCRP11274 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
BCRP11274 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
BCRP11274 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
BCRP11274 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BCRP11274 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
BCRP11274 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BCRP11274 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
BCRP11274 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
BCRP11274 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
BCRP11274 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
BCRP11274 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
BCRP11274 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
BCRP11274 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
BCRP11274 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
BCRP11274 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
BCRP11274 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
BCRP11274 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
BCRP11274 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BCRP11274 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BCRP11274 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BCRP11274 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BCRP11274 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BCRP11274 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BCRP11274 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BCRP11274 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BCRP11274 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BCRP11274 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BCRP11274 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BCRP11274 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BCRP11274 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BCRP11274 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BCRP11274 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
BCRP11274 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BCRP11274 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
BCRP11274 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
BCRP11274 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
BCRP11274 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
BCRP11274 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
BCRP11274 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BCRP11274 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
BCRP11274 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BCRP11274 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BCRP11274 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
BCRP11274 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BCRP11274 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
BCRP11274 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BCRP11274 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BCRP11274 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BCRP11274 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BCRP11274 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BCRP11274 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BCRP11274 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BCRP11274 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BCRP11274 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.3 ms