Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GLI4P10075 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GLI4P10075 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GLI4P10075 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GLI4P10075 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GLI4P10075 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GLI4P10075 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GLI4P10075 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GLI4P10075 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GLI4P10075 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GLI4P10075 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GLI4P10075 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GLI4P10075 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GLI4P10075 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GLI4P10075 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GLI4P10075 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GLI4P10075 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GLI4P10075 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GLI4P10075 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GLI4P10075 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GLI4P10075 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GLI4P10075 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GLI4P10075 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GLI4P10075 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GLI4P10075 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GLI4P10075 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GLI4P10075 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GLI4P10075 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GLI4P10075 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GLI4P10075 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GLI4P10075 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GLI4P10075 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GLI4P10075 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GLI4P10075 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GLI4P10075 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GLI4P10075 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GLI4P10075 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GLI4P10075 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GLI4P10075 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GLI4P10075 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GLI4P10075 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GLI4P10075 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GLI4P10075 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GLI4P10075 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GLI4P10075 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GLI4P10075 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GLI4P10075 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GLI4P10075 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GLI4P10075 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GLI4P10075 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GLI4P10075 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GLI4P10075 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GLI4P10075 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GLI4P10075 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GLI4P10075 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GLI4P10075 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GLI4P10075 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GLI4P10075 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GLI4P10075 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GLI4P10075 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GLI4P10075 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GLI4P10075 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GLI4P10075 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GLI4P10075 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GLI4P10075 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GLI4P10075 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GLI4P10075 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GLI4P10075 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GLI4P10075 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GLI4P10075 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GLI4P10075 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GLI4P10075 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GLI4P10075 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GLI4P10075 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GLI4P10075 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GLI4P10075 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GLI4P10075 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GLI4P10075 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GLI4P10075 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GLI4P10075 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GLI4P10075 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GLI4P10075 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GLI4P10075 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GLI4P10075 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GLI4P10075 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GLI4P10075 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GLI4P10075 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GLI4P10075 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GLI4P10075 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GLI4P10075 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GLI4P10075 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GLI4P10075 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GLI4P10075 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GLI4P10075 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GLI4P10075 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GLI4P10075 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GLI4P10075 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GLI4P10075 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GLI4P10075 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GLI4P10075 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms