Protein–RNA interactions for Protein: P0CL83

STAG3L1, Putative STAG3-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3L1P0CL83 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
STAG3L1P0CL83 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
STAG3L1P0CL83 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
STAG3L1P0CL83 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
STAG3L1P0CL83 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
STAG3L1P0CL83 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
STAG3L1P0CL83 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
STAG3L1P0CL83 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
STAG3L1P0CL83 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
STAG3L1P0CL83 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
STAG3L1P0CL83 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
STAG3L1P0CL83 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
STAG3L1P0CL83 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
STAG3L1P0CL83 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
STAG3L1P0CL83 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
STAG3L1P0CL83 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
STAG3L1P0CL83 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
STAG3L1P0CL83 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
STAG3L1P0CL83 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
STAG3L1P0CL83 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
STAG3L1P0CL83 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
STAG3L1P0CL83 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
STAG3L1P0CL83 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
STAG3L1P0CL83 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
STAG3L1P0CL83 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
STAG3L1P0CL83 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
STAG3L1P0CL83 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
STAG3L1P0CL83 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
STAG3L1P0CL83 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
STAG3L1P0CL83 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
STAG3L1P0CL83 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
STAG3L1P0CL83 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
STAG3L1P0CL83 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
STAG3L1P0CL83 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
STAG3L1P0CL83 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
STAG3L1P0CL83 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
STAG3L1P0CL83 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
STAG3L1P0CL83 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
STAG3L1P0CL83 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
STAG3L1P0CL83 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
STAG3L1P0CL83 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
STAG3L1P0CL83 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
STAG3L1P0CL83 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
STAG3L1P0CL83 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
STAG3L1P0CL83 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
STAG3L1P0CL83 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
STAG3L1P0CL83 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
STAG3L1P0CL83 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
STAG3L1P0CL83 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
STAG3L1P0CL83 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
STAG3L1P0CL83 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
STAG3L1P0CL83 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
STAG3L1P0CL83 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
STAG3L1P0CL83 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
STAG3L1P0CL83 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
STAG3L1P0CL83 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
STAG3L1P0CL83 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
STAG3L1P0CL83 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
STAG3L1P0CL83 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
STAG3L1P0CL83 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
STAG3L1P0CL83 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
STAG3L1P0CL83 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
STAG3L1P0CL83 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
STAG3L1P0CL83 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
STAG3L1P0CL83 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
STAG3L1P0CL83 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
STAG3L1P0CL83 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
STAG3L1P0CL83 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
STAG3L1P0CL83 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
STAG3L1P0CL83 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
STAG3L1P0CL83 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
STAG3L1P0CL83 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
STAG3L1P0CL83 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
STAG3L1P0CL83 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
STAG3L1P0CL83 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
STAG3L1P0CL83 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
STAG3L1P0CL83 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
STAG3L1P0CL83 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
STAG3L1P0CL83 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
STAG3L1P0CL83 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
STAG3L1P0CL83 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
STAG3L1P0CL83 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
STAG3L1P0CL83 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
STAG3L1P0CL83 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
STAG3L1P0CL83 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
STAG3L1P0CL83 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
STAG3L1P0CL83 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
STAG3L1P0CL83 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
STAG3L1P0CL83 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
STAG3L1P0CL83 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
STAG3L1P0CL83 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
STAG3L1P0CL83 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
STAG3L1P0CL83 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
STAG3L1P0CL83 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
STAG3L1P0CL83 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
STAG3L1P0CL83 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
STAG3L1P0CL83 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
STAG3L1P0CL83 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
STAG3L1P0CL83 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
STAG3L1P0CL83 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms