Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ79

ZNF888, Zinc finger protein 888, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF888P0CJ79 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF888P0CJ79 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF888P0CJ79 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF888P0CJ79 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF888P0CJ79 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF888P0CJ79 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF888P0CJ79 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF888P0CJ79 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF888P0CJ79 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF888P0CJ79 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF888P0CJ79 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF888P0CJ79 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF888P0CJ79 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF888P0CJ79 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF888P0CJ79 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF888P0CJ79 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF888P0CJ79 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF888P0CJ79 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF888P0CJ79 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF888P0CJ79 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF888P0CJ79 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF888P0CJ79 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF888P0CJ79 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF888P0CJ79 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF888P0CJ79 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF888P0CJ79 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF888P0CJ79 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF888P0CJ79 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF888P0CJ79 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF888P0CJ79 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF888P0CJ79 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF888P0CJ79 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ZNF888P0CJ79 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF888P0CJ79 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF888P0CJ79 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF888P0CJ79 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF888P0CJ79 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF888P0CJ79 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF888P0CJ79 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF888P0CJ79 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF888P0CJ79 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF888P0CJ79 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF888P0CJ79 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF888P0CJ79 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF888P0CJ79 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF888P0CJ79 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF888P0CJ79 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF888P0CJ79 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF888P0CJ79 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF888P0CJ79 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF888P0CJ79 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF888P0CJ79 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF888P0CJ79 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF888P0CJ79 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF888P0CJ79 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF888P0CJ79 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF888P0CJ79 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF888P0CJ79 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF888P0CJ79 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF888P0CJ79 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF888P0CJ79 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF888P0CJ79 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF888P0CJ79 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF888P0CJ79 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF888P0CJ79 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF888P0CJ79 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF888P0CJ79 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF888P0CJ79 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF888P0CJ79 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF888P0CJ79 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF888P0CJ79 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF888P0CJ79 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF888P0CJ79 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF888P0CJ79 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF888P0CJ79 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF888P0CJ79 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF888P0CJ79 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF888P0CJ79 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF888P0CJ79 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF888P0CJ79 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF888P0CJ79 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF888P0CJ79 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF888P0CJ79 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF888P0CJ79 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF888P0CJ79 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF888P0CJ79 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF888P0CJ79 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF888P0CJ79 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF888P0CJ79 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF888P0CJ79 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF888P0CJ79 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF888P0CJ79 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF888P0CJ79 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF888P0CJ79 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF888P0CJ79 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF888P0CJ79 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF888P0CJ79 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF888P0CJ79 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF888P0CJ79 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF888P0CJ79 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.2 ms