Protein–RNA interactions for Protein: P08708

RPS17, 40S ribosomal protein S17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS17P08708 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS17P08708 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS17P08708 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS17P08708 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS17P08708 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS17P08708 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS17P08708 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS17P08708 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS17P08708 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS17P08708 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS17P08708 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS17P08708 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS17P08708 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS17P08708 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS17P08708 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS17P08708 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS17P08708 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS17P08708 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS17P08708 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS17P08708 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS17P08708 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS17P08708 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS17P08708 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS17P08708 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS17P08708 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS17P08708 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS17P08708 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS17P08708 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS17P08708 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS17P08708 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS17P08708 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS17P08708 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS17P08708 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS17P08708 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS17P08708 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS17P08708 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS17P08708 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS17P08708 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS17P08708 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS17P08708 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS17P08708 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS17P08708 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS17P08708 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS17P08708 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS17P08708 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS17P08708 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS17P08708 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS17P08708 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS17P08708 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS17P08708 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS17P08708 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS17P08708 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS17P08708 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS17P08708 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS17P08708 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS17P08708 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS17P08708 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS17P08708 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS17P08708 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS17P08708 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS17P08708 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RPS17P08708 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS17P08708 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS17P08708 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS17P08708 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS17P08708 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS17P08708 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS17P08708 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS17P08708 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS17P08708 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS17P08708 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS17P08708 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS17P08708 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS17P08708 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS17P08708 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS17P08708 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS17P08708 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS17P08708 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS17P08708 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS17P08708 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS17P08708 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS17P08708 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS17P08708 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS17P08708 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS17P08708 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS17P08708 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS17P08708 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS17P08708 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS17P08708 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS17P08708 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS17P08708 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS17P08708 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS17P08708 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS17P08708 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS17P08708 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS17P08708 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS17P08708 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS17P08708 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS17P08708 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPS17P08708 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms