Protein–RNA interactions for Protein: P07358

C8B, Complement component C8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8BP07358 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C8BP07358 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C8BP07358 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
C8BP07358 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C8BP07358 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C8BP07358 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C8BP07358 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C8BP07358 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
C8BP07358 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C8BP07358 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C8BP07358 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C8BP07358 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C8BP07358 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C8BP07358 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C8BP07358 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C8BP07358 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C8BP07358 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C8BP07358 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C8BP07358 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C8BP07358 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C8BP07358 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C8BP07358 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C8BP07358 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C8BP07358 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C8BP07358 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C8BP07358 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C8BP07358 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C8BP07358 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C8BP07358 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C8BP07358 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C8BP07358 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C8BP07358 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C8BP07358 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
C8BP07358 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C8BP07358 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C8BP07358 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C8BP07358 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C8BP07358 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C8BP07358 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C8BP07358 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C8BP07358 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C8BP07358 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C8BP07358 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C8BP07358 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C8BP07358 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C8BP07358 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C8BP07358 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C8BP07358 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C8BP07358 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C8BP07358 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C8BP07358 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C8BP07358 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C8BP07358 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C8BP07358 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C8BP07358 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C8BP07358 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C8BP07358 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C8BP07358 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C8BP07358 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C8BP07358 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C8BP07358 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C8BP07358 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C8BP07358 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C8BP07358 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C8BP07358 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C8BP07358 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C8BP07358 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C8BP07358 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C8BP07358 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C8BP07358 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C8BP07358 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C8BP07358 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C8BP07358 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C8BP07358 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C8BP07358 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C8BP07358 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C8BP07358 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C8BP07358 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C8BP07358 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C8BP07358 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C8BP07358 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C8BP07358 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
C8BP07358 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C8BP07358 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C8BP07358 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C8BP07358 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C8BP07358 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C8BP07358 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C8BP07358 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C8BP07358 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C8BP07358 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C8BP07358 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C8BP07358 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C8BP07358 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C8BP07358 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C8BP07358 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C8BP07358 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C8BP07358 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
C8BP07358 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C8BP07358 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms