Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGAVP06756 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGAVP06756 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGAVP06756 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ITGAVP06756 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ITGAVP06756 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ITGAVP06756 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
ITGAVP06756 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ITGAVP06756 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGAVP06756 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGAVP06756 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGAVP06756 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGAVP06756 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGAVP06756 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGAVP06756 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGAVP06756 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGAVP06756 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGAVP06756 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGAVP06756 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGAVP06756 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGAVP06756 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGAVP06756 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGAVP06756 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGAVP06756 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGAVP06756 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGAVP06756 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGAVP06756 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGAVP06756 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGAVP06756 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGAVP06756 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGAVP06756 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGAVP06756 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGAVP06756 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGAVP06756 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGAVP06756 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGAVP06756 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGAVP06756 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGAVP06756 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGAVP06756 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGAVP06756 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGAVP06756 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGAVP06756 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGAVP06756 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGAVP06756 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGAVP06756 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGAVP06756 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGAVP06756 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGAVP06756 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGAVP06756 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGAVP06756 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGAVP06756 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGAVP06756 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGAVP06756 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGAVP06756 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGAVP06756 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGAVP06756 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGAVP06756 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGAVP06756 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGAVP06756 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGAVP06756 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGAVP06756 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGAVP06756 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGAVP06756 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGAVP06756 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGAVP06756 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGAVP06756 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGAVP06756 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGAVP06756 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ITGAVP06756 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ITGAVP06756 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ITGAVP06756 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ITGAVP06756 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ITGAVP06756 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGAVP06756 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGAVP06756 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGAVP06756 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGAVP06756 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGAVP06756 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGAVP06756 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGAVP06756 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGAVP06756 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGAVP06756 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGAVP06756 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGAVP06756 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGAVP06756 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGAVP06756 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGAVP06756 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGAVP06756 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGAVP06756 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGAVP06756 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGAVP06756 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGAVP06756 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGAVP06756 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGAVP06756 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGAVP06756 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGAVP06756 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGAVP06756 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ITGAVP06756 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ITGAVP06756 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGAVP06756 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms