Protein–RNA interactions for Protein: P04632

CAPNS1, Calpain small subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1P04632 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1P04632 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1P04632 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1P04632 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1P04632 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
CAPNS1P04632 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1P04632 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1P04632 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1P04632 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1P04632 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1P04632 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPNS1P04632 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPNS1P04632 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPNS1P04632 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CAPNS1P04632 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CAPNS1P04632 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CAPNS1P04632 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPNS1P04632 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CAPNS1P04632 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CAPNS1P04632 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CAPNS1P04632 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CAPNS1P04632 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1P04632 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1P04632 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1P04632 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1P04632 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1P04632 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1P04632 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1P04632 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1P04632 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1P04632 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1P04632 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1P04632 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1P04632 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1P04632 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1P04632 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1P04632 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1P04632 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1P04632 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1P04632 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1P04632 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1P04632 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1P04632 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1P04632 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1P04632 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1P04632 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1P04632 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1P04632 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1P04632 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1P04632 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1P04632 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1P04632 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1P04632 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1P04632 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1P04632 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1P04632 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1P04632 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1P04632 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1P04632 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1P04632 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1P04632 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPNS1P04632 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPNS1P04632 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPNS1P04632 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPNS1P04632 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPNS1P04632 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPNS1P04632 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1P04632 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1P04632 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1P04632 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1P04632 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1P04632 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1P04632 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1P04632 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1P04632 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1P04632 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1P04632 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1P04632 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1P04632 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1P04632 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1P04632 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1P04632 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1P04632 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1P04632 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1P04632 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1P04632 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1P04632 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1P04632 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1P04632 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1P04632 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1P04632 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1P04632 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1P04632 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1P04632 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
CAPNS1P04632 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CAPNS1P04632 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CAPNS1P04632 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CAPNS1P04632 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CAPNS1P04632 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1P04632 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms