Protein–RNA interactions for Protein: P04216

THY1, Thy-1 membrane glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THY1P04216 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
THY1P04216 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
THY1P04216 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
THY1P04216 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
THY1P04216 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
THY1P04216 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
THY1P04216 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
THY1P04216 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
THY1P04216 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
THY1P04216 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
THY1P04216 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
THY1P04216 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THY1P04216 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THY1P04216 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
THY1P04216 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
THY1P04216 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THY1P04216 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THY1P04216 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THY1P04216 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THY1P04216 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THY1P04216 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THY1P04216 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
THY1P04216 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
THY1P04216 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
THY1P04216 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THY1P04216 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
THY1P04216 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THY1P04216 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THY1P04216 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
THY1P04216 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
THY1P04216 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
THY1P04216 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THY1P04216 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
THY1P04216 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THY1P04216 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
THY1P04216 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
THY1P04216 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
THY1P04216 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THY1P04216 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
THY1P04216 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THY1P04216 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
THY1P04216 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THY1P04216 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
THY1P04216 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THY1P04216 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THY1P04216 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THY1P04216 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THY1P04216 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THY1P04216 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
THY1P04216 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
THY1P04216 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
THY1P04216 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
THY1P04216 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
THY1P04216 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
THY1P04216 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
THY1P04216 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
THY1P04216 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
THY1P04216 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
THY1P04216 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
THY1P04216 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
THY1P04216 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
THY1P04216 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
THY1P04216 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
THY1P04216 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
THY1P04216 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
THY1P04216 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
THY1P04216 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
THY1P04216 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
THY1P04216 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
THY1P04216 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
THY1P04216 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THY1P04216 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THY1P04216 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THY1P04216 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THY1P04216 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THY1P04216 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THY1P04216 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THY1P04216 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THY1P04216 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THY1P04216 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THY1P04216 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THY1P04216 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THY1P04216 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
THY1P04216 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
THY1P04216 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
THY1P04216 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
THY1P04216 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
THY1P04216 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
THY1P04216 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
THY1P04216 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
THY1P04216 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
THY1P04216 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
THY1P04216 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
THY1P04216 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
THY1P04216 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
THY1P04216 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
THY1P04216 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
THY1P04216 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
THY1P04216 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
THY1P04216 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms