Protein–RNA interactions for Protein: O75865

TRAPPC6A, Trafficking protein particle complex subunit 6A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6AO75865 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC6AO75865 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC6AO75865 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC6AO75865 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC6AO75865 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC6AO75865 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC6AO75865 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRAPPC6AO75865 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC6AO75865 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC6AO75865 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC6AO75865 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC6AO75865 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC6AO75865 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC6AO75865 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC6AO75865 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC6AO75865 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAPPC6AO75865 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAPPC6AO75865 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAPPC6AO75865 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC6AO75865 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC6AO75865 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC6AO75865 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC6AO75865 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC6AO75865 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC6AO75865 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC6AO75865 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC6AO75865 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC6AO75865 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC6AO75865 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC6AO75865 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC6AO75865 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC6AO75865 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC6AO75865 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC6AO75865 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC6AO75865 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC6AO75865 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC6AO75865 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC6AO75865 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC6AO75865 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC6AO75865 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC6AO75865 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC6AO75865 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC6AO75865 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC6AO75865 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC6AO75865 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC6AO75865 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC6AO75865 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC6AO75865 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC6AO75865 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC6AO75865 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC6AO75865 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC6AO75865 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC6AO75865 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAPPC6AO75865 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAPPC6AO75865 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAPPC6AO75865 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAPPC6AO75865 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAPPC6AO75865 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAPPC6AO75865 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAPPC6AO75865 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAPPC6AO75865 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAPPC6AO75865 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAPPC6AO75865 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAPPC6AO75865 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAPPC6AO75865 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAPPC6AO75865 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAPPC6AO75865 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAPPC6AO75865 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAPPC6AO75865 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAPPC6AO75865 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAPPC6AO75865 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAPPC6AO75865 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAPPC6AO75865 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAPPC6AO75865 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAPPC6AO75865 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAPPC6AO75865 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAPPC6AO75865 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAPPC6AO75865 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAPPC6AO75865 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRAPPC6AO75865 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRAPPC6AO75865 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRAPPC6AO75865 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRAPPC6AO75865 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAPPC6AO75865 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAPPC6AO75865 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC6AO75865 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC6AO75865 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC6AO75865 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC6AO75865 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC6AO75865 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC6AO75865 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC6AO75865 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC6AO75865 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC6AO75865 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC6AO75865 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC6AO75865 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC6AO75865 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC6AO75865 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC6AO75865 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC6AO75865 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms