Protein–RNA interactions for Protein: O75678

RFPL2, Ret finger protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL2O75678 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RFPL2O75678 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RFPL2O75678 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RFPL2O75678 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RFPL2O75678 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RFPL2O75678 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RFPL2O75678 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RFPL2O75678 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RFPL2O75678 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RFPL2O75678 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RFPL2O75678 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RFPL2O75678 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RFPL2O75678 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RFPL2O75678 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RFPL2O75678 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RFPL2O75678 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RFPL2O75678 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RFPL2O75678 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RFPL2O75678 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RFPL2O75678 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RFPL2O75678 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RFPL2O75678 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RFPL2O75678 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RFPL2O75678 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RFPL2O75678 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RFPL2O75678 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RFPL2O75678 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RFPL2O75678 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RFPL2O75678 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RFPL2O75678 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RFPL2O75678 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RFPL2O75678 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RFPL2O75678 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RFPL2O75678 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RFPL2O75678 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RFPL2O75678 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RFPL2O75678 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RFPL2O75678 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RFPL2O75678 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RFPL2O75678 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RFPL2O75678 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RFPL2O75678 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RFPL2O75678 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RFPL2O75678 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RFPL2O75678 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RFPL2O75678 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RFPL2O75678 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RFPL2O75678 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RFPL2O75678 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RFPL2O75678 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RFPL2O75678 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
RFPL2O75678 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RFPL2O75678 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RFPL2O75678 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RFPL2O75678 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RFPL2O75678 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RFPL2O75678 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RFPL2O75678 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RFPL2O75678 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RFPL2O75678 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RFPL2O75678 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFPL2O75678 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFPL2O75678 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFPL2O75678 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFPL2O75678 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RFPL2O75678 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RFPL2O75678 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RFPL2O75678 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RFPL2O75678 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RFPL2O75678 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RFPL2O75678 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RFPL2O75678 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RFPL2O75678 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RFPL2O75678 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RFPL2O75678 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RFPL2O75678 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RFPL2O75678 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RFPL2O75678 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RFPL2O75678 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RFPL2O75678 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RFPL2O75678 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RFPL2O75678 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RFPL2O75678 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RFPL2O75678 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RFPL2O75678 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RFPL2O75678 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RFPL2O75678 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RFPL2O75678 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RFPL2O75678 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RFPL2O75678 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RFPL2O75678 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RFPL2O75678 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RFPL2O75678 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RFPL2O75678 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RFPL2O75678 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RFPL2O75678 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RFPL2O75678 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RFPL2O75678 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RFPL2O75678 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RFPL2O75678 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms