Protein–RNA interactions for Protein: O60885

BRD4, Bromodomain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4O60885 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
BRD4O60885 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
BRD4O60885 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
BRD4O60885 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
BRD4O60885 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC33.79■■■■□ 3
BRD4O60885 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
BRD4O60885 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
BRD4O60885 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
BRD4O60885 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
BRD4O60885 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC33.77■■■■□ 3
BRD4O60885 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
BRD4O60885 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
BRD4O60885 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
BRD4O60885 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
BRD4O60885 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
BRD4O60885 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
BRD4O60885 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
BRD4O60885 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
BRD4O60885 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
BRD4O60885 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
BRD4O60885 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
BRD4O60885 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
BRD4O60885 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
BRD4O60885 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
BRD4O60885 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
BRD4O60885 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
BRD4O60885 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
BRD4O60885 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
BRD4O60885 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
BRD4O60885 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
BRD4O60885 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
BRD4O60885 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
BRD4O60885 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
BRD4O60885 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
BRD4O60885 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
BRD4O60885 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
BRD4O60885 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
BRD4O60885 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
BRD4O60885 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
BRD4O60885 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
BRD4O60885 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
BRD4O60885 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
BRD4O60885 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
BRD4O60885 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
BRD4O60885 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
BRD4O60885 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
BRD4O60885 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
BRD4O60885 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
BRD4O60885 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
BRD4O60885 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
BRD4O60885 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
BRD4O60885 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
BRD4O60885 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
BRD4O60885 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
BRD4O60885 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
BRD4O60885 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
BRD4O60885 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
BRD4O60885 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
BRD4O60885 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
BRD4O60885 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
BRD4O60885 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
BRD4O60885 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
BRD4O60885 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
BRD4O60885 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
BRD4O60885 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
BRD4O60885 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
BRD4O60885 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC33.64■■■□□ 2.98
BRD4O60885 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
BRD4O60885 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
BRD4O60885 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
BRD4O60885 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
BRD4O60885 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
BRD4O60885 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
BRD4O60885 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC33.62■■■□□ 2.97
BRD4O60885 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
BRD4O60885 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
BRD4O60885 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
BRD4O60885 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
BRD4O60885 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
BRD4O60885 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
BRD4O60885 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
BRD4O60885 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
BRD4O60885 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
BRD4O60885 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
BRD4O60885 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
BRD4O60885 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
BRD4O60885 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
BRD4O60885 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
BRD4O60885 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
BRD4O60885 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
BRD4O60885 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
BRD4O60885 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
BRD4O60885 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
BRD4O60885 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
BRD4O60885 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
BRD4O60885 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
BRD4O60885 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
BRD4O60885 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
BRD4O60885 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
BRD4O60885 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.5 ms