Protein–RNA interactions for Protein: O43815

STRN, Striatin, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRNO43815 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
STRNO43815 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
STRNO43815 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
STRNO43815 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
STRNO43815 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
STRNO43815 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
STRNO43815 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
STRNO43815 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
STRNO43815 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
STRNO43815 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
STRNO43815 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
STRNO43815 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
STRNO43815 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
STRNO43815 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
STRNO43815 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
STRNO43815 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
STRNO43815 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
STRNO43815 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
STRNO43815 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
STRNO43815 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
STRNO43815 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
STRNO43815 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
STRNO43815 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
STRNO43815 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
STRNO43815 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
STRNO43815 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
STRNO43815 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
STRNO43815 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
STRNO43815 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
STRNO43815 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
STRNO43815 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
STRNO43815 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
STRNO43815 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
STRNO43815 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
STRNO43815 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
STRNO43815 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
STRNO43815 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
STRNO43815 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
STRNO43815 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
STRNO43815 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
STRNO43815 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
STRNO43815 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
STRNO43815 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
STRNO43815 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
STRNO43815 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
STRNO43815 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
STRNO43815 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
STRNO43815 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
STRNO43815 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
STRNO43815 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
STRNO43815 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
STRNO43815 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
STRNO43815 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
STRNO43815 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
STRNO43815 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
STRNO43815 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
STRNO43815 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
STRNO43815 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
STRNO43815 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
STRNO43815 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
STRNO43815 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
STRNO43815 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
STRNO43815 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
STRNO43815 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
STRNO43815 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
STRNO43815 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
STRNO43815 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
STRNO43815 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
STRNO43815 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
STRNO43815 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
STRNO43815 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
STRNO43815 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
STRNO43815 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
STRNO43815 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
STRNO43815 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
STRNO43815 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
STRNO43815 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
STRNO43815 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
STRNO43815 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
STRNO43815 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
STRNO43815 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
STRNO43815 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
STRNO43815 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
STRNO43815 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
STRNO43815 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
STRNO43815 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
STRNO43815 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
STRNO43815 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
STRNO43815 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
STRNO43815 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
STRNO43815 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
STRNO43815 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
STRNO43815 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
STRNO43815 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
STRNO43815 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
STRNO43815 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
STRNO43815 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
STRNO43815 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
STRNO43815 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
STRNO43815 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms