Protein–RNA interactions for Protein: O43529

CHST10, Carbohydrate sulfotransferase 10, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST10O43529 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHST10O43529 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHST10O43529 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHST10O43529 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHST10O43529 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHST10O43529 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHST10O43529 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHST10O43529 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHST10O43529 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHST10O43529 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHST10O43529 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHST10O43529 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHST10O43529 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHST10O43529 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHST10O43529 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHST10O43529 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CHST10O43529 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHST10O43529 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHST10O43529 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHST10O43529 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHST10O43529 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CHST10O43529 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CHST10O43529 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHST10O43529 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHST10O43529 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHST10O43529 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHST10O43529 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHST10O43529 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHST10O43529 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHST10O43529 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHST10O43529 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHST10O43529 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHST10O43529 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHST10O43529 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHST10O43529 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHST10O43529 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHST10O43529 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHST10O43529 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHST10O43529 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHST10O43529 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHST10O43529 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHST10O43529 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHST10O43529 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHST10O43529 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHST10O43529 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHST10O43529 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHST10O43529 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHST10O43529 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHST10O43529 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHST10O43529 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHST10O43529 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHST10O43529 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHST10O43529 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHST10O43529 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHST10O43529 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHST10O43529 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHST10O43529 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHST10O43529 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHST10O43529 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHST10O43529 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHST10O43529 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHST10O43529 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHST10O43529 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHST10O43529 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHST10O43529 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHST10O43529 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHST10O43529 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHST10O43529 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHST10O43529 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHST10O43529 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHST10O43529 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHST10O43529 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHST10O43529 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHST10O43529 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHST10O43529 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHST10O43529 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHST10O43529 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHST10O43529 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHST10O43529 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHST10O43529 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHST10O43529 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHST10O43529 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CHST10O43529 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHST10O43529 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHST10O43529 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHST10O43529 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHST10O43529 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHST10O43529 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHST10O43529 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHST10O43529 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHST10O43529 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHST10O43529 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHST10O43529 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHST10O43529 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHST10O43529 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHST10O43529 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHST10O43529 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHST10O43529 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHST10O43529 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHST10O43529 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms