Protein–RNA interactions for Protein: O00505

KPNA3, Importin subunit alpha-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA3O00505 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KPNA3O00505 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KPNA3O00505 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KPNA3O00505 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KPNA3O00505 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KPNA3O00505 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KPNA3O00505 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KPNA3O00505 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KPNA3O00505 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KPNA3O00505 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KPNA3O00505 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KPNA3O00505 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KPNA3O00505 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KPNA3O00505 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KPNA3O00505 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KPNA3O00505 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KPNA3O00505 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KPNA3O00505 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KPNA3O00505 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KPNA3O00505 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KPNA3O00505 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KPNA3O00505 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KPNA3O00505 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KPNA3O00505 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KPNA3O00505 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KPNA3O00505 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KPNA3O00505 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KPNA3O00505 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KPNA3O00505 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KPNA3O00505 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KPNA3O00505 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KPNA3O00505 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KPNA3O00505 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KPNA3O00505 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KPNA3O00505 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KPNA3O00505 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KPNA3O00505 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KPNA3O00505 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KPNA3O00505 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KPNA3O00505 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KPNA3O00505 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KPNA3O00505 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KPNA3O00505 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KPNA3O00505 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KPNA3O00505 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KPNA3O00505 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KPNA3O00505 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KPNA3O00505 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KPNA3O00505 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KPNA3O00505 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KPNA3O00505 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KPNA3O00505 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KPNA3O00505 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KPNA3O00505 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KPNA3O00505 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KPNA3O00505 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KPNA3O00505 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KPNA3O00505 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KPNA3O00505 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KPNA3O00505 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KPNA3O00505 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KPNA3O00505 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KPNA3O00505 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KPNA3O00505 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KPNA3O00505 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KPNA3O00505 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KPNA3O00505 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KPNA3O00505 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KPNA3O00505 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KPNA3O00505 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KPNA3O00505 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KPNA3O00505 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KPNA3O00505 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KPNA3O00505 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KPNA3O00505 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KPNA3O00505 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KPNA3O00505 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KPNA3O00505 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KPNA3O00505 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KPNA3O00505 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KPNA3O00505 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KPNA3O00505 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KPNA3O00505 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KPNA3O00505 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KPNA3O00505 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KPNA3O00505 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KPNA3O00505 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KPNA3O00505 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KPNA3O00505 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KPNA3O00505 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KPNA3O00505 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KPNA3O00505 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KPNA3O00505 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KPNA3O00505 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KPNA3O00505 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KPNA3O00505 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KPNA3O00505 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KPNA3O00505 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KPNA3O00505 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KPNA3O00505 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms