Protein–RNA interactions for Protein: H7C1H1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1H1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
H7C1H1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H7C1H1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H7C1H1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H7C1H1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H7C1H1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H7C1H1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
H7C1H1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
H7C1H1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
H7C1H1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H7C1H1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H7C1H1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H7C1H1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
H7C1H1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H7C1H1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H7C1H1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
H7C1H1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H7C1H1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H7C1H1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
H7C1H1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H7C1H1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H7C1H1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H7C1H1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H7C1H1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
H7C1H1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H7C1H1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
H7C1H1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H7C1H1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H7C1H1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H7C1H1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
H7C1H1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
H7C1H1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H7C1H1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H7C1H1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
H7C1H1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H7C1H1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
H7C1H1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H7C1H1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H7C1H1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
H7C1H1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H7C1H1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H7C1H1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
H7C1H1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H7C1H1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H7C1H1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
H7C1H1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H7C1H1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H7C1H1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H7C1H1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H7C1H1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H7C1H1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H7C1H1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H7C1H1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H7C1H1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H7C1H1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H7C1H1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H7C1H1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
H7C1H1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H7C1H1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H7C1H1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H7C1H1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H7C1H1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H7C1H1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H7C1H1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H7C1H1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H7C1H1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H7C1H1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H7C1H1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H7C1H1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H7C1H1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H7C1H1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H7C1H1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H7C1H1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H7C1H1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
H7C1H1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
H7C1H1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H7C1H1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
H7C1H1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
H7C1H1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H7C1H1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H7C1H1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H7C1H1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H7C1H1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H7C1H1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H7C1H1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
H7C1H1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
H7C1H1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H7C1H1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H7C1H1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H7C1H1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
H7C1H1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H7C1H1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H7C1H1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H7C1H1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
H7C1H1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
H7C1H1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
H7C1H1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H7C1H1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H7C1H1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
H7C1H1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms