Protein–RNA interactions for Protein: H3BV60

TGFBR3L, Transforming growth factor-beta receptor type 3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR3LH3BV60 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TGFBR3LH3BV60 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TGFBR3LH3BV60 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TGFBR3LH3BV60 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TGFBR3LH3BV60 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TGFBR3LH3BV60 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TGFBR3LH3BV60 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TGFBR3LH3BV60 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TGFBR3LH3BV60 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TGFBR3LH3BV60 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TGFBR3LH3BV60 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TGFBR3LH3BV60 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TGFBR3LH3BV60 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TGFBR3LH3BV60 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TGFBR3LH3BV60 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TGFBR3LH3BV60 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TGFBR3LH3BV60 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TGFBR3LH3BV60 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TGFBR3LH3BV60 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TGFBR3LH3BV60 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TGFBR3LH3BV60 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TGFBR3LH3BV60 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TGFBR3LH3BV60 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TGFBR3LH3BV60 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TGFBR3LH3BV60 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TGFBR3LH3BV60 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TGFBR3LH3BV60 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TGFBR3LH3BV60 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TGFBR3LH3BV60 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TGFBR3LH3BV60 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TGFBR3LH3BV60 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TGFBR3LH3BV60 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TGFBR3LH3BV60 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TGFBR3LH3BV60 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TGFBR3LH3BV60 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TGFBR3LH3BV60 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TGFBR3LH3BV60 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TGFBR3LH3BV60 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TGFBR3LH3BV60 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TGFBR3LH3BV60 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TGFBR3LH3BV60 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TGFBR3LH3BV60 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TGFBR3LH3BV60 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TGFBR3LH3BV60 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TGFBR3LH3BV60 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TGFBR3LH3BV60 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TGFBR3LH3BV60 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TGFBR3LH3BV60 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TGFBR3LH3BV60 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TGFBR3LH3BV60 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TGFBR3LH3BV60 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TGFBR3LH3BV60 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TGFBR3LH3BV60 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TGFBR3LH3BV60 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TGFBR3LH3BV60 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TGFBR3LH3BV60 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TGFBR3LH3BV60 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TGFBR3LH3BV60 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TGFBR3LH3BV60 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TGFBR3LH3BV60 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TGFBR3LH3BV60 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TGFBR3LH3BV60 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TGFBR3LH3BV60 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TGFBR3LH3BV60 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TGFBR3LH3BV60 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TGFBR3LH3BV60 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TGFBR3LH3BV60 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TGFBR3LH3BV60 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TGFBR3LH3BV60 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TGFBR3LH3BV60 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TGFBR3LH3BV60 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TGFBR3LH3BV60 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TGFBR3LH3BV60 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TGFBR3LH3BV60 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TGFBR3LH3BV60 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TGFBR3LH3BV60 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TGFBR3LH3BV60 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TGFBR3LH3BV60 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TGFBR3LH3BV60 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TGFBR3LH3BV60 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TGFBR3LH3BV60 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TGFBR3LH3BV60 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TGFBR3LH3BV60 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TGFBR3LH3BV60 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TGFBR3LH3BV60 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TGFBR3LH3BV60 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TGFBR3LH3BV60 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TGFBR3LH3BV60 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TGFBR3LH3BV60 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TGFBR3LH3BV60 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TGFBR3LH3BV60 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TGFBR3LH3BV60 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TGFBR3LH3BV60 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TGFBR3LH3BV60 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TGFBR3LH3BV60 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TGFBR3LH3BV60 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TGFBR3LH3BV60 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TGFBR3LH3BV60 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TGFBR3LH3BV60 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TGFBR3LH3BV60 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms