Protein–RNA interactions for Protein: B9A030

TISP43, Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TISP43B9A030 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TISP43B9A030 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TISP43B9A030 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TISP43B9A030 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TISP43B9A030 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TISP43B9A030 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TISP43B9A030 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TISP43B9A030 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TISP43B9A030 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TISP43B9A030 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TISP43B9A030 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TISP43B9A030 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TISP43B9A030 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TISP43B9A030 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TISP43B9A030 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TISP43B9A030 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TISP43B9A030 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TISP43B9A030 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TISP43B9A030 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TISP43B9A030 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TISP43B9A030 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TISP43B9A030 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TISP43B9A030 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TISP43B9A030 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TISP43B9A030 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TISP43B9A030 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TISP43B9A030 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TISP43B9A030 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TISP43B9A030 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TISP43B9A030 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TISP43B9A030 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TISP43B9A030 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TISP43B9A030 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TISP43B9A030 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TISP43B9A030 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TISP43B9A030 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TISP43B9A030 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TISP43B9A030 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TISP43B9A030 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TISP43B9A030 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TISP43B9A030 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TISP43B9A030 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TISP43B9A030 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TISP43B9A030 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TISP43B9A030 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TISP43B9A030 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TISP43B9A030 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TISP43B9A030 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TISP43B9A030 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TISP43B9A030 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TISP43B9A030 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TISP43B9A030 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TISP43B9A030 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TISP43B9A030 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TISP43B9A030 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TISP43B9A030 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TISP43B9A030 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TISP43B9A030 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TISP43B9A030 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TISP43B9A030 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TISP43B9A030 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TISP43B9A030 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TISP43B9A030 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TISP43B9A030 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TISP43B9A030 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TISP43B9A030 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TISP43B9A030 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TISP43B9A030 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TISP43B9A030 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TISP43B9A030 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TISP43B9A030 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TISP43B9A030 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TISP43B9A030 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TISP43B9A030 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TISP43B9A030 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TISP43B9A030 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TISP43B9A030 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TISP43B9A030 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TISP43B9A030 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TISP43B9A030 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TISP43B9A030 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TISP43B9A030 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TISP43B9A030 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TISP43B9A030 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TISP43B9A030 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TISP43B9A030 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TISP43B9A030 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TISP43B9A030 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TISP43B9A030 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TISP43B9A030 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TISP43B9A030 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TISP43B9A030 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TISP43B9A030 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TISP43B9A030 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TISP43B9A030 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TISP43B9A030 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TISP43B9A030 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TISP43B9A030 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TISP43B9A030 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TISP43B9A030 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms