Protein–RNA interactions for Protein: B8ZZF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B8ZZF3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
B8ZZF3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
B8ZZF3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
B8ZZF3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
B8ZZF3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
B8ZZF3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
B8ZZF3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
B8ZZF3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
B8ZZF3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
B8ZZF3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
B8ZZF3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
B8ZZF3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
B8ZZF3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
B8ZZF3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
B8ZZF3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
B8ZZF3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
B8ZZF3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
B8ZZF3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
B8ZZF3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
B8ZZF3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
B8ZZF3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
B8ZZF3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
B8ZZF3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
B8ZZF3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
B8ZZF3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
B8ZZF3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
B8ZZF3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
B8ZZF3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
B8ZZF3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
B8ZZF3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
B8ZZF3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
B8ZZF3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
B8ZZF3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
B8ZZF3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
B8ZZF3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
B8ZZF3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
B8ZZF3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
B8ZZF3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
B8ZZF3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
B8ZZF3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
B8ZZF3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
B8ZZF3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
B8ZZF3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
B8ZZF3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
B8ZZF3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
B8ZZF3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
B8ZZF3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
B8ZZF3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
B8ZZF3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
B8ZZF3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
B8ZZF3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
B8ZZF3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
B8ZZF3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
B8ZZF3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
B8ZZF3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
B8ZZF3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
B8ZZF3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
B8ZZF3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
B8ZZF3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
B8ZZF3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
B8ZZF3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
B8ZZF3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
B8ZZF3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
B8ZZF3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
B8ZZF3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
B8ZZF3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
B8ZZF3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
B8ZZF3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
B8ZZF3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
B8ZZF3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
B8ZZF3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
B8ZZF3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
B8ZZF3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
B8ZZF3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
B8ZZF3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
B8ZZF3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
B8ZZF3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
B8ZZF3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
B8ZZF3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
B8ZZF3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
B8ZZF3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
B8ZZF3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
B8ZZF3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
B8ZZF3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
B8ZZF3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
B8ZZF3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
B8ZZF3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
B8ZZF3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
B8ZZF3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
B8ZZF3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
B8ZZF3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
B8ZZF3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
B8ZZF3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
B8ZZF3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
B8ZZF3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
B8ZZF3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
B8ZZF3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
B8ZZF3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
B8ZZF3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
B8ZZF3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms