Protein–RNA interactions for Protein: B5ME19

EIF3CL, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C-like protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3CLB5ME19 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EIF3CLB5ME19 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EIF3CLB5ME19 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EIF3CLB5ME19 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EIF3CLB5ME19 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EIF3CLB5ME19 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EIF3CLB5ME19 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EIF3CLB5ME19 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EIF3CLB5ME19 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EIF3CLB5ME19 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EIF3CLB5ME19 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EIF3CLB5ME19 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EIF3CLB5ME19 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EIF3CLB5ME19 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EIF3CLB5ME19 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EIF3CLB5ME19 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EIF3CLB5ME19 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EIF3CLB5ME19 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
EIF3CLB5ME19 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EIF3CLB5ME19 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
EIF3CLB5ME19 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EIF3CLB5ME19 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EIF3CLB5ME19 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
EIF3CLB5ME19 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EIF3CLB5ME19 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EIF3CLB5ME19 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EIF3CLB5ME19 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EIF3CLB5ME19 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EIF3CLB5ME19 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EIF3CLB5ME19 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EIF3CLB5ME19 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EIF3CLB5ME19 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
EIF3CLB5ME19 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
EIF3CLB5ME19 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
EIF3CLB5ME19 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EIF3CLB5ME19 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EIF3CLB5ME19 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
EIF3CLB5ME19 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EIF3CLB5ME19 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EIF3CLB5ME19 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26■■□□□ 1.75
EIF3CLB5ME19 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EIF3CLB5ME19 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EIF3CLB5ME19 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EIF3CLB5ME19 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EIF3CLB5ME19 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EIF3CLB5ME19 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EIF3CLB5ME19 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EIF3CLB5ME19 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EIF3CLB5ME19 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EIF3CLB5ME19 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EIF3CLB5ME19 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EIF3CLB5ME19 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EIF3CLB5ME19 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EIF3CLB5ME19 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EIF3CLB5ME19 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EIF3CLB5ME19 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EIF3CLB5ME19 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EIF3CLB5ME19 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EIF3CLB5ME19 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EIF3CLB5ME19 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EIF3CLB5ME19 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EIF3CLB5ME19 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EIF3CLB5ME19 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
EIF3CLB5ME19 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
EIF3CLB5ME19 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
EIF3CLB5ME19 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
EIF3CLB5ME19 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EIF3CLB5ME19 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EIF3CLB5ME19 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EIF3CLB5ME19 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EIF3CLB5ME19 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EIF3CLB5ME19 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EIF3CLB5ME19 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EIF3CLB5ME19 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EIF3CLB5ME19 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EIF3CLB5ME19 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EIF3CLB5ME19 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EIF3CLB5ME19 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EIF3CLB5ME19 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
EIF3CLB5ME19 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EIF3CLB5ME19 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EIF3CLB5ME19 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EIF3CLB5ME19 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EIF3CLB5ME19 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EIF3CLB5ME19 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EIF3CLB5ME19 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EIF3CLB5ME19 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EIF3CLB5ME19 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EIF3CLB5ME19 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EIF3CLB5ME19 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EIF3CLB5ME19 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EIF3CLB5ME19 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EIF3CLB5ME19 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EIF3CLB5ME19 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EIF3CLB5ME19 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EIF3CLB5ME19 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EIF3CLB5ME19 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
EIF3CLB5ME19 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
EIF3CLB5ME19 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EIF3CLB5ME19 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms