Protein–RNA interactions for Protein: B3EWG3

FAM25A, Protein FAM25A, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM25AB3EWG3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM25AB3EWG3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM25AB3EWG3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM25AB3EWG3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM25AB3EWG3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM25AB3EWG3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM25AB3EWG3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM25AB3EWG3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM25AB3EWG3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM25AB3EWG3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM25AB3EWG3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM25AB3EWG3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM25AB3EWG3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM25AB3EWG3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM25AB3EWG3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM25AB3EWG3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM25AB3EWG3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM25AB3EWG3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM25AB3EWG3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM25AB3EWG3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM25AB3EWG3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM25AB3EWG3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM25AB3EWG3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM25AB3EWG3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM25AB3EWG3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM25AB3EWG3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM25AB3EWG3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM25AB3EWG3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM25AB3EWG3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM25AB3EWG3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM25AB3EWG3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM25AB3EWG3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM25AB3EWG3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM25AB3EWG3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM25AB3EWG3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM25AB3EWG3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM25AB3EWG3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM25AB3EWG3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM25AB3EWG3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM25AB3EWG3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM25AB3EWG3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM25AB3EWG3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM25AB3EWG3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM25AB3EWG3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM25AB3EWG3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM25AB3EWG3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM25AB3EWG3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM25AB3EWG3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM25AB3EWG3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM25AB3EWG3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM25AB3EWG3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FAM25AB3EWG3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FAM25AB3EWG3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FAM25AB3EWG3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FAM25AB3EWG3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FAM25AB3EWG3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FAM25AB3EWG3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM25AB3EWG3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM25AB3EWG3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM25AB3EWG3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM25AB3EWG3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM25AB3EWG3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM25AB3EWG3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM25AB3EWG3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM25AB3EWG3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM25AB3EWG3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM25AB3EWG3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM25AB3EWG3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM25AB3EWG3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM25AB3EWG3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM25AB3EWG3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM25AB3EWG3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM25AB3EWG3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM25AB3EWG3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM25AB3EWG3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM25AB3EWG3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM25AB3EWG3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM25AB3EWG3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM25AB3EWG3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM25AB3EWG3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM25AB3EWG3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM25AB3EWG3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM25AB3EWG3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM25AB3EWG3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM25AB3EWG3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM25AB3EWG3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM25AB3EWG3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM25AB3EWG3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM25AB3EWG3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM25AB3EWG3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM25AB3EWG3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM25AB3EWG3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM25AB3EWG3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM25AB3EWG3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM25AB3EWG3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM25AB3EWG3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM25AB3EWG3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FAM25AB3EWG3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM25AB3EWG3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM25AB3EWG3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms