Protein–RNA interactions for Protein: A8MUK1

USP17L5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L5A8MUK1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP17L5A8MUK1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP17L5A8MUK1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP17L5A8MUK1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP17L5A8MUK1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP17L5A8MUK1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP17L5A8MUK1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP17L5A8MUK1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP17L5A8MUK1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP17L5A8MUK1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP17L5A8MUK1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP17L5A8MUK1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP17L5A8MUK1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP17L5A8MUK1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP17L5A8MUK1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
USP17L5A8MUK1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP17L5A8MUK1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
USP17L5A8MUK1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP17L5A8MUK1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP17L5A8MUK1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP17L5A8MUK1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP17L5A8MUK1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP17L5A8MUK1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
USP17L5A8MUK1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
USP17L5A8MUK1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP17L5A8MUK1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP17L5A8MUK1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP17L5A8MUK1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP17L5A8MUK1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP17L5A8MUK1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP17L5A8MUK1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP17L5A8MUK1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP17L5A8MUK1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP17L5A8MUK1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP17L5A8MUK1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP17L5A8MUK1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
USP17L5A8MUK1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP17L5A8MUK1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP17L5A8MUK1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP17L5A8MUK1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP17L5A8MUK1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP17L5A8MUK1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP17L5A8MUK1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
USP17L5A8MUK1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP17L5A8MUK1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP17L5A8MUK1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP17L5A8MUK1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP17L5A8MUK1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
USP17L5A8MUK1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP17L5A8MUK1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP17L5A8MUK1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP17L5A8MUK1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP17L5A8MUK1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP17L5A8MUK1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP17L5A8MUK1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP17L5A8MUK1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP17L5A8MUK1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP17L5A8MUK1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP17L5A8MUK1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP17L5A8MUK1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP17L5A8MUK1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP17L5A8MUK1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
USP17L5A8MUK1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP17L5A8MUK1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP17L5A8MUK1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP17L5A8MUK1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP17L5A8MUK1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP17L5A8MUK1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP17L5A8MUK1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP17L5A8MUK1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP17L5A8MUK1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP17L5A8MUK1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP17L5A8MUK1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP17L5A8MUK1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP17L5A8MUK1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP17L5A8MUK1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP17L5A8MUK1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP17L5A8MUK1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
USP17L5A8MUK1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP17L5A8MUK1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP17L5A8MUK1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP17L5A8MUK1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP17L5A8MUK1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP17L5A8MUK1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP17L5A8MUK1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP17L5A8MUK1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP17L5A8MUK1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP17L5A8MUK1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP17L5A8MUK1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP17L5A8MUK1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP17L5A8MUK1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP17L5A8MUK1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP17L5A8MUK1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP17L5A8MUK1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP17L5A8MUK1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP17L5A8MUK1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
USP17L5A8MUK1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
USP17L5A8MUK1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP17L5A8MUK1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP17L5A8MUK1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 198.1 ms