Protein–RNA interactions for Protein: A6NJI9

LRRC72, Leucine-rich repeat-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC72A6NJI9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC72A6NJI9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC72A6NJI9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC72A6NJI9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC72A6NJI9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC72A6NJI9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC72A6NJI9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC72A6NJI9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC72A6NJI9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC72A6NJI9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC72A6NJI9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC72A6NJI9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC72A6NJI9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC72A6NJI9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC72A6NJI9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC72A6NJI9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC72A6NJI9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC72A6NJI9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC72A6NJI9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC72A6NJI9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC72A6NJI9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC72A6NJI9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC72A6NJI9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC72A6NJI9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC72A6NJI9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC72A6NJI9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC72A6NJI9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC72A6NJI9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC72A6NJI9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC72A6NJI9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC72A6NJI9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC72A6NJI9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC72A6NJI9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC72A6NJI9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC72A6NJI9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC72A6NJI9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC72A6NJI9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC72A6NJI9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC72A6NJI9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC72A6NJI9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC72A6NJI9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC72A6NJI9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC72A6NJI9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC72A6NJI9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC72A6NJI9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC72A6NJI9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC72A6NJI9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC72A6NJI9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC72A6NJI9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC72A6NJI9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC72A6NJI9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC72A6NJI9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC72A6NJI9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC72A6NJI9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC72A6NJI9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC72A6NJI9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC72A6NJI9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC72A6NJI9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC72A6NJI9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC72A6NJI9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC72A6NJI9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC72A6NJI9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC72A6NJI9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC72A6NJI9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC72A6NJI9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC72A6NJI9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC72A6NJI9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC72A6NJI9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC72A6NJI9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC72A6NJI9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC72A6NJI9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC72A6NJI9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC72A6NJI9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRRC72A6NJI9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRRC72A6NJI9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC72A6NJI9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC72A6NJI9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC72A6NJI9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC72A6NJI9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC72A6NJI9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC72A6NJI9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC72A6NJI9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC72A6NJI9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC72A6NJI9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC72A6NJI9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC72A6NJI9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC72A6NJI9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC72A6NJI9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC72A6NJI9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC72A6NJI9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC72A6NJI9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC72A6NJI9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC72A6NJI9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC72A6NJI9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC72A6NJI9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC72A6NJI9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC72A6NJI9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC72A6NJI9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC72A6NJI9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC72A6NJI9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms