Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC69A6NI79 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC69A6NI79 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC69A6NI79 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC69A6NI79 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC69A6NI79 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC69A6NI79 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC69A6NI79 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC69A6NI79 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC69A6NI79 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC69A6NI79 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC69A6NI79 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC69A6NI79 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC69A6NI79 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC69A6NI79 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC69A6NI79 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC69A6NI79 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC69A6NI79 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC69A6NI79 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC69A6NI79 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC69A6NI79 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC69A6NI79 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC69A6NI79 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC69A6NI79 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC69A6NI79 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC69A6NI79 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC69A6NI79 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC69A6NI79 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC69A6NI79 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC69A6NI79 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC69A6NI79 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC69A6NI79 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC69A6NI79 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC69A6NI79 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC69A6NI79 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC69A6NI79 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC69A6NI79 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC69A6NI79 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC69A6NI79 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC69A6NI79 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC69A6NI79 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC69A6NI79 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CCDC69A6NI79 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC69A6NI79 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC69A6NI79 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC69A6NI79 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC69A6NI79 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC69A6NI79 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC69A6NI79 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC69A6NI79 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC69A6NI79 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC69A6NI79 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC69A6NI79 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC69A6NI79 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC69A6NI79 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC69A6NI79 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC69A6NI79 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC69A6NI79 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC69A6NI79 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC69A6NI79 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC69A6NI79 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC69A6NI79 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC69A6NI79 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC69A6NI79 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC69A6NI79 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC69A6NI79 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC69A6NI79 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC69A6NI79 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC69A6NI79 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC69A6NI79 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC69A6NI79 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC69A6NI79 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC69A6NI79 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC69A6NI79 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC69A6NI79 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC69A6NI79 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC69A6NI79 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC69A6NI79 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC69A6NI79 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC69A6NI79 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC69A6NI79 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC69A6NI79 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC69A6NI79 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC69A6NI79 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC69A6NI79 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC69A6NI79 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC69A6NI79 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC69A6NI79 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC69A6NI79 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC69A6NI79 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC69A6NI79 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC69A6NI79 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC69A6NI79 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC69A6NI79 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC69A6NI79 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC69A6NI79 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC69A6NI79 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC69A6NI79 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC69A6NI79 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC69A6NI79 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms