Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
A4D1N5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
A4D1N5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
A4D1N5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
A4D1N5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
A4D1N5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
A4D1N5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
A4D1N5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
A4D1N5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
A4D1N5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
A4D1N5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
A4D1N5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
A4D1N5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
A4D1N5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
A4D1N5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
A4D1N5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
A4D1N5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
A4D1N5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
A4D1N5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
A4D1N5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
A4D1N5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
A4D1N5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
A4D1N5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
A4D1N5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
A4D1N5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
A4D1N5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
A4D1N5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
A4D1N5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
A4D1N5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A4D1N5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A4D1N5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
A4D1N5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A4D1N5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A4D1N5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A4D1N5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
A4D1N5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
A4D1N5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A4D1N5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
A4D1N5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
A4D1N5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
A4D1N5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A4D1N5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A4D1N5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A4D1N5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A4D1N5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A4D1N5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A4D1N5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A4D1N5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A4D1N5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A4D1N5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A4D1N5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A4D1N5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A4D1N5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A4D1N5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A4D1N5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
A4D1N5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
A4D1N5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A4D1N5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A4D1N5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A4D1N5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
A4D1N5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A4D1N5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A4D1N5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
A4D1N5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A4D1N5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A4D1N5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
A4D1N5 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A4D1N5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A4D1N5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A4D1N5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A4D1N5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
A4D1N5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
A4D1N5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
A4D1N5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A4D1N5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A4D1N5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A4D1N5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
A4D1N5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A4D1N5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A4D1N5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A4D1N5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A4D1N5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A4D1N5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A4D1N5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A4D1N5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A4D1N5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A4D1N5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A4D1N5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
A4D1N5 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A4D1N5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
A4D1N5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A4D1N5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
A4D1N5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
A4D1N5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A4D1N5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
A4D1N5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
A4D1N5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
A4D1N5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A4D1N5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A4D1N5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.5 ms