Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRD1A4D1F6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRD1A4D1F6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRD1A4D1F6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRD1A4D1F6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRD1A4D1F6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRD1A4D1F6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRD1A4D1F6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRD1A4D1F6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRD1A4D1F6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRD1A4D1F6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRD1A4D1F6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRD1A4D1F6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRD1A4D1F6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRD1A4D1F6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRD1A4D1F6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRD1A4D1F6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRD1A4D1F6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRD1A4D1F6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRD1A4D1F6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRD1A4D1F6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRD1A4D1F6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRD1A4D1F6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRD1A4D1F6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRD1A4D1F6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRD1A4D1F6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRD1A4D1F6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRD1A4D1F6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRD1A4D1F6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRD1A4D1F6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRD1A4D1F6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRD1A4D1F6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRD1A4D1F6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRD1A4D1F6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRD1A4D1F6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRD1A4D1F6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRD1A4D1F6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRD1A4D1F6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRD1A4D1F6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRD1A4D1F6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRD1A4D1F6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRD1A4D1F6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRD1A4D1F6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRD1A4D1F6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRD1A4D1F6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRD1A4D1F6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRD1A4D1F6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRD1A4D1F6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRD1A4D1F6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRD1A4D1F6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRD1A4D1F6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRD1A4D1F6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRD1A4D1F6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRD1A4D1F6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRD1A4D1F6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRD1A4D1F6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRD1A4D1F6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRD1A4D1F6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRD1A4D1F6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRD1A4D1F6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRD1A4D1F6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRD1A4D1F6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRD1A4D1F6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRD1A4D1F6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRD1A4D1F6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRD1A4D1F6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRD1A4D1F6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRD1A4D1F6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRD1A4D1F6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRD1A4D1F6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRD1A4D1F6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRD1A4D1F6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRD1A4D1F6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRD1A4D1F6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRD1A4D1F6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRD1A4D1F6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRD1A4D1F6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRD1A4D1F6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRD1A4D1F6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRD1A4D1F6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRD1A4D1F6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRD1A4D1F6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRD1A4D1F6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRD1A4D1F6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRD1A4D1F6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRD1A4D1F6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRD1A4D1F6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRD1A4D1F6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRD1A4D1F6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRD1A4D1F6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRD1A4D1F6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRD1A4D1F6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRD1A4D1F6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRD1A4D1F6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRD1A4D1F6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRD1A4D1F6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRD1A4D1F6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRD1A4D1F6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRD1A4D1F6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRD1A4D1F6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms