Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YVX5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YVX5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A0J9YVX5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A0J9YVX5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A0J9YVX5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A0J9YVX5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A0J9YVX5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A0J9YVX5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A0J9YVX5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A0J9YVX5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A0J9YVX5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A0J9YVX5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A0J9YVX5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A0J9YVX5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A0J9YVX5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A0J9YVX5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A0J9YVX5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A0J9YVX5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A0J9YVX5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A0J9YVX5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A0J9YVX5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A0J9YVX5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A0J9YVX5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A0J9YVX5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A0J9YVX5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A0J9YVX5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A0J9YVX5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A0J9YVX5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A0J9YVX5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A0J9YVX5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A0J9YVX5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A0J9YVX5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A0J9YVX5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A0J9YVX5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A0J9YVX5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A0J9YVX5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A0J9YVX5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A0J9YVX5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A0J9YVX5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A0J9YVX5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A0J9YVX5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A0J9YVX5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A0J9YVX5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A0J9YVX5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A0J9YVX5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A0J9YVX5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A0J9YVX5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A0J9YVX5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A0J9YVX5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A0J9YVX5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A0J9YVX5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A0J9YVX5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A0J9YVX5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A0J9YVX5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A0J9YVX5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A0J9YVX5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A0J9YVX5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A0J9YVX5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A0J9YVX5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A0J9YVX5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A0J9YVX5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A0J9YVX5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A0J9YVX5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A0J9YVX5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A0J9YVX5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A0J9YVX5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A0J9YVX5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A0J9YVX5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A0J9YVX5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A0J9YVX5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A0J9YVX5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A0J9YVX5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A0J9YVX5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A0J9YVX5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A0J9YVX5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A0J9YVX5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A0J9YVX5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A0J9YVX5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A0J9YVX5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A0J9YVX5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
A0A0J9YVX5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
A0A0J9YVX5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
A0A0J9YVX5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
A0A0J9YVX5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
A0A0J9YVX5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A0J9YVX5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A0J9YVX5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A0J9YVX5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A0J9YVX5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A0J9YVX5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A0J9YVX5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A0J9YVX5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A0J9YVX5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A0J9YVX5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A0J9YVX5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A0J9YVX5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A0J9YVX5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A0J9YVX5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A0J9YVX5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A0J9YVX5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A0J9YVX5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms