Protein–RNA interactions for Protein: Q53H54

TRMT12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT12Q53H54 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms