Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAPN6Q9Y6Q1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CAPN6Q9Y6Q1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CAPN6Q9Y6Q1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPN6Q9Y6Q1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPN6Q9Y6Q1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPN6Q9Y6Q1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPN6Q9Y6Q1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPN6Q9Y6Q1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPN6Q9Y6Q1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPN6Q9Y6Q1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPN6Q9Y6Q1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPN6Q9Y6Q1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAPN6Q9Y6Q1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAPN6Q9Y6Q1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAPN6Q9Y6Q1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAPN6Q9Y6Q1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAPN6Q9Y6Q1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAPN6Q9Y6Q1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAPN6Q9Y6Q1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAPN6Q9Y6Q1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAPN6Q9Y6Q1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAPN6Q9Y6Q1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPN6Q9Y6Q1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPN6Q9Y6Q1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPN6Q9Y6Q1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPN6Q9Y6Q1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPN6Q9Y6Q1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPN6Q9Y6Q1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPN6Q9Y6Q1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPN6Q9Y6Q1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAPN6Q9Y6Q1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAPN6Q9Y6Q1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAPN6Q9Y6Q1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAPN6Q9Y6Q1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAPN6Q9Y6Q1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAPN6Q9Y6Q1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAPN6Q9Y6Q1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAPN6Q9Y6Q1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAPN6Q9Y6Q1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAPN6Q9Y6Q1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAPN6Q9Y6Q1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAPN6Q9Y6Q1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPN6Q9Y6Q1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPN6Q9Y6Q1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPN6Q9Y6Q1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPN6Q9Y6Q1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPN6Q9Y6Q1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPN6Q9Y6Q1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPN6Q9Y6Q1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPN6Q9Y6Q1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPN6Q9Y6Q1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CAPN6Q9Y6Q1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAPN6Q9Y6Q1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAPN6Q9Y6Q1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAPN6Q9Y6Q1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAPN6Q9Y6Q1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAPN6Q9Y6Q1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAPN6Q9Y6Q1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAPN6Q9Y6Q1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAPN6Q9Y6Q1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAPN6Q9Y6Q1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAPN6Q9Y6Q1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAPN6Q9Y6Q1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAPN6Q9Y6Q1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPN6Q9Y6Q1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPN6Q9Y6Q1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPN6Q9Y6Q1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPN6Q9Y6Q1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPN6Q9Y6Q1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPN6Q9Y6Q1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPN6Q9Y6Q1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPN6Q9Y6Q1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPN6Q9Y6Q1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPN6Q9Y6Q1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPN6Q9Y6Q1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPN6Q9Y6Q1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAPN6Q9Y6Q1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAPN6Q9Y6Q1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAPN6Q9Y6Q1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAPN6Q9Y6Q1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAPN6Q9Y6Q1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAPN6Q9Y6Q1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CAPN6Q9Y6Q1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAPN6Q9Y6Q1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CAPN6Q9Y6Q1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CAPN6Q9Y6Q1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CAPN6Q9Y6Q1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAPN6Q9Y6Q1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAPN6Q9Y6Q1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAPN6Q9Y6Q1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPN6Q9Y6Q1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPN6Q9Y6Q1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPN6Q9Y6Q1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPN6Q9Y6Q1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPN6Q9Y6Q1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
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