Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
ARFGEF2Q9Y6D5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
ARFGEF2Q9Y6D5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
ARFGEF2Q9Y6D5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
ARFGEF2Q9Y6D5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
ARFGEF2Q9Y6D5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
ARFGEF2Q9Y6D5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
ARFGEF2Q9Y6D5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
ARFGEF2Q9Y6D5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ARFGEF2Q9Y6D5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ARFGEF2Q9Y6D5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ARFGEF2Q9Y6D5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ARFGEF2Q9Y6D5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ARFGEF2Q9Y6D5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ARFGEF2Q9Y6D5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ARFGEF2Q9Y6D5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ARFGEF2Q9Y6D5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ARFGEF2Q9Y6D5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
ARFGEF2Q9Y6D5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ARFGEF2Q9Y6D5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ARFGEF2Q9Y6D5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
ARFGEF2Q9Y6D5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ARFGEF2Q9Y6D5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ARFGEF2Q9Y6D5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ARFGEF2Q9Y6D5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ARFGEF2Q9Y6D5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ARFGEF2Q9Y6D5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ARFGEF2Q9Y6D5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ARFGEF2Q9Y6D5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC31■■■□□ 2.55
ARFGEF2Q9Y6D5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ARFGEF2Q9Y6D5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ARFGEF2Q9Y6D5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ARFGEF2Q9Y6D5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ARFGEF2Q9Y6D5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ARFGEF2Q9Y6D5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ARFGEF2Q9Y6D5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ARFGEF2Q9Y6D5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ARFGEF2Q9Y6D5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ARFGEF2Q9Y6D5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ARFGEF2Q9Y6D5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
ARFGEF2Q9Y6D5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ARFGEF2Q9Y6D5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ARFGEF2Q9Y6D5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ARFGEF2Q9Y6D5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
ARFGEF2Q9Y6D5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ARFGEF2Q9Y6D5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
ARFGEF2Q9Y6D5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ARFGEF2Q9Y6D5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ARFGEF2Q9Y6D5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ARFGEF2Q9Y6D5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ARFGEF2Q9Y6D5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ARFGEF2Q9Y6D5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
ARFGEF2Q9Y6D5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ARFGEF2Q9Y6D5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
ARFGEF2Q9Y6D5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ARFGEF2Q9Y6D5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ARFGEF2Q9Y6D5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
ARFGEF2Q9Y6D5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ARFGEF2Q9Y6D5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ARFGEF2Q9Y6D5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ARFGEF2Q9Y6D5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ARFGEF2Q9Y6D5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ARFGEF2Q9Y6D5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ARFGEF2Q9Y6D5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ARFGEF2Q9Y6D5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ARFGEF2Q9Y6D5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ARFGEF2Q9Y6D5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ARFGEF2Q9Y6D5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ARFGEF2Q9Y6D5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ARFGEF2Q9Y6D5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ARFGEF2Q9Y6D5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ARFGEF2Q9Y6D5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ARFGEF2Q9Y6D5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ARFGEF2Q9Y6D5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
ARFGEF2Q9Y6D5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ARFGEF2Q9Y6D5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ARFGEF2Q9Y6D5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
ARFGEF2Q9Y6D5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ARFGEF2Q9Y6D5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ARFGEF2Q9Y6D5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ARFGEF2Q9Y6D5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ARFGEF2Q9Y6D5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ARFGEF2Q9Y6D5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ARFGEF2Q9Y6D5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ARFGEF2Q9Y6D5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ARFGEF2Q9Y6D5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ARFGEF2Q9Y6D5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ARFGEF2Q9Y6D5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
ARFGEF2Q9Y6D5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
ARFGEF2Q9Y6D5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms