Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKP3Q9Y446 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKP3Q9Y446 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PKP3Q9Y446 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKP3Q9Y446 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKP3Q9Y446 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKP3Q9Y446 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKP3Q9Y446 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKP3Q9Y446 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKP3Q9Y446 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKP3Q9Y446 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKP3Q9Y446 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKP3Q9Y446 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKP3Q9Y446 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PKP3Q9Y446 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKP3Q9Y446 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKP3Q9Y446 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKP3Q9Y446 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKP3Q9Y446 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKP3Q9Y446 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKP3Q9Y446 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKP3Q9Y446 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PKP3Q9Y446 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PKP3Q9Y446 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKP3Q9Y446 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKP3Q9Y446 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PKP3Q9Y446 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PKP3Q9Y446 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PKP3Q9Y446 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PKP3Q9Y446 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKP3Q9Y446 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKP3Q9Y446 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKP3Q9Y446 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKP3Q9Y446 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKP3Q9Y446 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKP3Q9Y446 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKP3Q9Y446 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKP3Q9Y446 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKP3Q9Y446 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKP3Q9Y446 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKP3Q9Y446 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKP3Q9Y446 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKP3Q9Y446 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKP3Q9Y446 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKP3Q9Y446 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKP3Q9Y446 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKP3Q9Y446 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKP3Q9Y446 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKP3Q9Y446 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKP3Q9Y446 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKP3Q9Y446 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKP3Q9Y446 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKP3Q9Y446 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKP3Q9Y446 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKP3Q9Y446 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKP3Q9Y446 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKP3Q9Y446 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKP3Q9Y446 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKP3Q9Y446 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKP3Q9Y446 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKP3Q9Y446 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKP3Q9Y446 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PKP3Q9Y446 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKP3Q9Y446 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKP3Q9Y446 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKP3Q9Y446 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PKP3Q9Y446 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PKP3Q9Y446 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PKP3Q9Y446 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKP3Q9Y446 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKP3Q9Y446 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKP3Q9Y446 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PKP3Q9Y446 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKP3Q9Y446 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKP3Q9Y446 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKP3Q9Y446 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKP3Q9Y446 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKP3Q9Y446 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKP3Q9Y446 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKP3Q9Y446 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKP3Q9Y446 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PKP3Q9Y446 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKP3Q9Y446 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKP3Q9Y446 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKP3Q9Y446 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKP3Q9Y446 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKP3Q9Y446 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKP3Q9Y446 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKP3Q9Y446 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKP3Q9Y446 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKP3Q9Y446 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PKP3Q9Y446 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKP3Q9Y446 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKP3Q9Y446 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKP3Q9Y446 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKP3Q9Y446 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKP3Q9Y446 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKP3Q9Y446 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKP3Q9Y446 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKP3Q9Y446 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms